Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

Différences entre les versions de « Génomique Évolutive et Médicale »

De Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle
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* La caractérisation des '''relations génotype/phénotype''', en particulier dans le cadre de maladies génétiques complexes
 
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* La compréhension de l’'''évolution de systèmes biologiques''', qu’il s’agisse de processus biologiques ou d’espèces.  
 
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Pour ce faire, nous utilisons et développons un large panel d'approches :
 
Pour ce faire, nous utilisons et développons un large panel d'approches :
 
* analyse de séquences biologiques
 
* analyse de séquences biologiques
* étude des relations séquences/structure/fonction
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* étude des relations séquence/structure/fonction
 
* génomique comparative intra- et inter-espèces
 
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* graphes
 
* graphes

Version du 30 juin 2022 à 15:36

Responsable : Odile LECOMPTE

Participants permanents : Nathalie AL MAKDESSI, Ali AYADI, Anne JEANNIN, Claudine MAYER, Christian MICHEL, Luc MOULINIER, Olivier POCH, Laetitia POIDEVIN, Jean-Sébastien SERENI, Julie THOMPSON

Post-doctorant : Kirsley CHENNEN

Ingénieur contractuel : Arnaud KRESS

Doctorants : Lena BONASSIN, Luka Ljudevit BOSTJANCIC, Célia ENDERLIN, Corentin MEYER, Christelle RUTZ, Alix SIMON

Objectifs et approches

Nos travaux sont centrés sur l’extraction de connaissances à partir de données omiques (génomes, transcriptomes, protéomes, métabolomes, lipidomes, interactomes) avec deux objectifs principaux :

  • La caractérisation des relations génotype/phénotype, en particulier dans le cadre de maladies génétiques complexes
  • La compréhension de l’évolution de systèmes biologiques, qu’il s’agisse de processus biologiques ou d’espèces.


Pour ce faire, nous utilisons et développons un large panel d'approches :

  • analyse de séquences biologiques
  • étude des relations séquence/structure/fonction
  • génomique comparative intra- et inter-espèces
  • graphes
  • intelligence artificielle

Une des spécificités de notre équipe réside dans l’exploitation de méthodes bio-informatiques traditionnelles afin de générer des connaissances qui peuvent ensuite guider des approches d’intelligence artificielle. Cette combinaison originale repose sur la pluralité et la complémentarité des compétences internes à l’équipe.

Champs d'applications et projets en cours