Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

Anne Jeannin-Girardon

De Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle
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Maîtresse de Conférences HDR en informatique (section 27) au Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie, UMR CNRS 7357 -- Université de Strasbourg,


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TL;DR -- Je m'intéresse à l'intelligence artificielle et à l'apprentissage automatique et aux questions épistémologiques et éthiques qui entourent ce domaine.

Je m’intéresse aujourd’hui à l’apprentissage automatique et à l’intelligence artificielle, tant d’un point de vue fondamental que pratique, par des recherches sur l’apprentissage par transfert, l’interprétabilité des modèles, leur incertitude ou encore sur la représentation des connaissances et avec des applications en bioinformatique ou en optimisation par exemple. En surplomb, j’essaye de mener une réflexion autour des questions épistémologiques et éthiques qui se posent lorsque l’on s’intéresse au domaine de l’intelligence artificielle.


Publications

Liste des publications

Implication dans des projets

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Encadrement scientifique

Encadrement de thèses

  • Ali Khudiyev [Oct. 2022 -] (Directrices : A. Jeannin-Girardon & Latafat Gardashova) Intelligence artificielle neuro-symbolique
  • Quentin Christoffel [Oct. 2021-] (Directrice: A. Deruyver) Réduction des incertitudes des réseaux de neurones profonds par injection de connaissance
  • Hiba Khodji [Oct. 2020-] (Directeurs: J. Thompson & P. Collet) Prédiction d'erreur dans des alignements de séquences de gènes par réseaux convolutifs
  • Nicolas Scalzitti [Dec. 2018- Sept. 2021] (Directeurs: J. Thompson & P. Collet) "New gene annotation and detection strategies for genome sequencing projects, by massively parallel coupled artificial intelligence and artificial evolution algorithms"
  • Romain Orhand [Oct. 2018 - Nov. 2022] (Directeurs: P. Collet & P. Parrend) "Towards autonomous computers by combination of artificial intelligence and artificial evolution'
  • Anna Ouskova [Aout 2018- Mai 2022] (Directeurs: P. Collet & P. Parrend) "Evolutionary optimization of refrigeration systems using magnetocaloric alloy"

Encadrement d'étudiants en alternance

Encadrement de stages

  • 2022
    • [master 2] L. Wehrli / Interprétabilité des réseaux de neurones artificiels (co-encadrement avec S. Marc-Zwecker et D. Bernhard)
  • 2021
    • [master 2] Q. Christoffel / évaluation de l'incertitude de modèles d'apprentissage automatique par approche Bayesienne
  • 2020
    • [master 2] H. Khodji / quantification de la transférabilité des caractéristiques latentes de réseaux de neurones profonds
    • [master 1] Q. Christoffel / algorithmes génétiques pour l'explicabilité des réseaux de neurones profonds
  • 2019
    • [master 1] A. Oury Bah / algorithmes génétiques pour l'explicabilité des réseaux de neurones profonds
    • [master 1] A. Hutt / quantification de la transférabilité des caractéristiques latentes de réseaux de neurones profonds
    • [master 1 math] Corentin Mengel / ATLAS: Algebraic TopoLogy for dAta Similarity
  • 2017
    • [master 2] N. Demeurre / Réseaux de régulation génétique de lymphocytes B
    • [master 1] F. Delhomme et M. Vila (co-encadrement avec Basile Sauvage, MCF équipe IGG) Cartes concentriques multi-valuées (a.k.a. Magellan)

Encadrement d'étudiants dans le cadre de projets de recherche (~150h)

  • 2020-21
    • N. Mountasir / étude comparatives de méthodes d'évaluation d'incertitude de réseaux de neurones profonds
    • E. Chetouane / interprétabilité de réseaux de neurones artificiels (co-encadrement avec S. Marc-Zwecker et D. Bernhard)
  • 2019-20
    • Q. Christoffel / algorithmes évolutionnaires pour l'explicabilité des réseaux de neurones profonds
    • F. Nawfal / étude comparative de méthodes d'apprentissage par transfert
  • 2018-19
    • Elisa Kalbé "Collision detection: comparison of cognitive and geometric approaches"
    • Gaël Mukunde "Apprentissage et identification de propriétés au sein des séquences de protéines" (Avec O. Poch & L. Moulinier)
    • Mathieu Haller "Apprentissage profond pour la classification de repliements de protéines" (Avec C. Mayer)
    • Amarin Hutt "Apprentissage multi-tâches, apprentissage par transfert : adaptabilité des réseaux de neurones" (Avec R. Orhand)
  • 2017-18
    • Elisa Kalbé "Non-representational approaches for agent behavior modelling"
    • Maxime Seyer "Non-representational approaches for agent behavior modelling"


Diffusion scientifique

  • [Jan. 2023] "Intelligence artificielle, éthique et santé", intervention à la conférence IA de l'ESBS "L'IA au service de la santé : éthique et cas d'usage"
  • [Juin 2022] "Intelligence artificielle : de la technique aux enjeux sociaux", intervention à la journée doctorale de l'université de Haute Alsace à Mulhouse
  • [Fev. 2020] "Quelle intégration des systèmes intelligents dans nos sociétés ?" Intervention a la table ronde Intelligence artificielle et démocratie: vers quelles interactions et enjeux ? du Jardin des Sciences de l'université de Strasbourg
  • [Nov. 2019] "Transfert learning: review and recent advances", workshop de l'axe de recherche Data Science and Artificial Intelligence de ICube
  • [Oct. 2018] "Défis théoriques et pratiques de l'intelligence artificielle" Présentation aux Journées Systèmes 2018 à Strasbourg / Vidéo de l'intervention
  • [2016, 2017] Animation (avec Pierre Collet) du stand du Campus Numérique des Systèmes Complexes de la Fête de la Science


Enseignement

Depuis 2016

  • Introduction à la programmation web
  • Algorithmique et programmation
  • Anglais pour l'informatique
  • Programmation orientée objet
  • Intelligence artificielle & deep learning

Avant 2016 (Univ. Brest)

  • Algorithmique et programmation
  • Certificat informatique et internet
  • Environnements informatiques
  • Langages de programmation
  • Algorithmique fondamentale et graphes
  • Programmation C avancée
  • Java et outillage projet
  • Réseaux IP: concepts, programmation et applications
  • Modélisation cognitive et réactive
  • Compilation, modèles et langages pour les systèmes parallèles

Responsabilités administratives et scientifiques

Responsabilités administratives

  • Responsable pédagogique de la L3 informatique de l'UFR Math-Info de l'université de Strasbourg depuis sept. 2020
  • Membre du conseil de l'UFR Mathématique et Informatique de l'Université de Strasbourg de décembre 2017 à décembre 2021
  • Coordinatrice pédagogique du parcours Math-Info de la licence de l'Université franco-azerbaïdjanaise (UFAZ): septembre 2017 à décembre 2020
  • Membre du Comité d'Experts en informatique 27è section de l'Université de Strasbourg depuis septembre 2016
  • Membre du comité de sélection pour un poste de maître de conférences en informatique à l'IUT Robert Schuman (2017)

Responsabilités scientifiques

  • Révision d'article pour le journal AIMS Cell and Tissue Engineering (2017)
  • Révision d'articles pour la conférence EA 2017
  • Membre des comités d'organisation et de programme de la conférence EA 2017
  • Révision d'article pour la conférence ICAROB 2018
  • Expertise scientifique de dossier de thèse CIFRE pour l'ANRT (2017, 2018)
  • Expertise scientifique pour le pôle de compétitivité BioWin (Wallonie) (2017)

Contact

Mon bureau est au CRBS (Centre de Recherche en Biomédecine de Strasbourg) au 1 rue Eugnène Boeckel, 67100 Strasbourg

Anne Jeannin-Girardon
ICUBE - UMR CNRS 7357
Tél : +33 (0)3.68.85.45.80 / Fax : +33 (0)3.68.85.44.55

1 rue Eugène Boeckel, CS 60026, 67084 Strasbourg

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