Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

Actualités

De Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle
Aller à la navigation Aller à la recherche

Vie de l'équipe

AVRIL 2016
         
* Publication de "Standardized benchmarking in the quest for orthologs" dans Nature Methods
 
MARS 2016
         
 Les réunions d'équipe hebdomadaires se dérouleront le mardi à 14h à partir de Mars.
 L'ordre des présentations des groupes reste inchangé. 
 Programmation des réunions des permanents tous les premiers Mardis du mois.

* 03/03 : réunion préparation de l'HCERES, bilan sur le wiki CSTB
* 08/03 : ELIXIR All Hands meeting Barcelone 7-9 Mars (participants J. Thompson/O. Poch) 
           https://www.elixir-europe.org/events/elixir-all-hands-2016
* 11/03 : présentation Systèmes immunitaires artificiels par Cédric Pupka vendredi à 14h (Encadrant P. Parrend)
* 15/03 : Arrivée Stagiaire Anna Leontova (Encadrant J. Thompson)
* 16/03 : 4P Factory workshop, 4P-Factory e-room + Grand Amphi de Math Unistra (P. Parrend)    
           https://4pfactory.wordpress.com/4p-factory-workshop-2016-program/
* 17/03 : Meeting Bilan Annuel de l'ANR Infrastructure BIPBIP (21 participants) à Strasbourg (locaux CSTB)
* 22/03 : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
* 25/03 : Journée "L’innovation scientifique au service des patients" 
journées « Science Days » de SANOFI Présentation Poster VarScrut Paris 
Centre de Congrès Les Pyramides, Le Port-Marly (78) (O. Poch)
* 31/03 : Visite Introduction à la recherche (étudiants de L3)         
* Déplacement de P. Collet à Bakou pour le montage d'une nouvelle université, l'Université Franco-Azerbaïdjanaise (UFAZ)
* Visite de Amy Gooch (Université de Durham) du 21 mars au 1er avril
* Finalisation du volume Springer Proceedings in Complexity ''First Complex Systems Digital Campus World E-Conference 2015'' (Editors P. Bourgine, P. Collet, P. Parrend).
* Papiers acceptés à Gecco et CEC
 
FEVRIER 2016 * 2 ANR sur 3 ont passé la phase 1 * papier EvoBio accepté * 12/02 : réunion SATT Connectus, Licence VarScrut * 22/02 : Arrivée Stagiaire Master Cédric Pupka (Encadrant Pierre Parrend) * 25/02 : AG ICube
JANVIER 2016
         
 Les réunions d'équipe hebdomadaires du mercredi se dérouleront le Jeudi à partir de
Janvier, l'ordre des présentations des groupes reste inchangé.
* 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Hélène Gass (Encadrant J. Thompson) 
* 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Morgane Gilg (Encadrant J. Thompson) 
* 06/01 : Réunion des permanents du CSTB, debriefing des Bingi Days Retraite de l'équipe
(10 et 11 décembre à la maison des associations à Strasbourg)
* 11/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Vanessa Fernandes-Cardoso (Encadrant Olivier Poch) 
* 18/01 : Réunion budget, regroupement et identification des informations en prévision de l'HCERES
* 22/01 : présentation des chaires et Unitwin UNESCO-Unistra à l'Institut Lebel (Pierre Collet)
* 25-26/01 : Assemblée générale de l'institut français de bioinformatique, participation aux
ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la
participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch)
* 27/01 : présentation d'Alexis Allot (ancien thésard)          

'*'*************2015 Equipe BFO ****************'*'

  • 9-11 décembre 2015 : Bingi Days, retraite CSTB à la Maison des Associations, place des Orphelins
  • 9 octobre 2015 : Alexis ALLOT a soutenu sa thèse en bioinformatique.
  • 8 octobre2015 : Carlos BERMEJO DAS NEVES a soutenu sa mi-thèse en bioinformatique.
  • 1er octobre 2015 : Arrivées des premiers stagiaires / étudiants de la thèmatique SONIC dans les locaux de la Faculté de Médecine.


Réunions d'équipe

Le mardi de 14h00 à 15h, Salle 526, Faculté de Médecine, CSTB 5e étage - 11 rue Humann

2016

Avril

  • 05 avril : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Bilan des présentations stagiaires /concours / mi-thèse à venir

Mars

  • 29 mars : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
  • 22 mars : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
  • 15 mars : Présentation des travaux, groupe B
  • 08 mars : Présentation des travaux, groupe A
  • 03 mars : Réunion préparatoire de l'HCERES
  • 01 mars : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Liste des points à aborder à la réunion préparatoire de l'HCERES le 03 mars
    • Bilan des entrées/sorties au CSTB
    • Bilan des financements

Février

  • 24 février : Présentation des travaux, groupe B
  • 17 février : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
  • 10 février : Présentation des travaux, groupe A
  • 04 février : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Bilan des activités de janvier : a- CR ComDir Icube du 01/02, b- CR AG IFB du 26/01.
    • Finances/appels d'offre
    • Divers

Janvier

  • 28 janvier : Présentation des travaux, groupe B
  • 20 janvier : Présentation des travaux, groupe A
  • 13 janvier : Présentation skype de Salma Aouled El Haj
  • 06 janvier : Réunion des permanents :
    • Préparation HCERES
    • Debriefing Bingi Days
    • Financements

2015

Décembre

  • 16 décembre: Présentation de Nicolas Lachiche ‘clowdflows : an open sourced cloud based platform for composition, execution, and sharing of interactive machine learning and data mining workflows’.
  • 9-11 décembre: Bingi Days, retraite CSTB
  • 02 décembre: Troisième réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB

Novembre

  • 27 novembre : Présentation des travaux, groupe A
  • 19 novembre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
  • 11 novembre : Férié
  • 4 novembre : Seconde réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB

Octobre

  • 28 octobre : Présentation des travaux, groupe B
  • 21 octobre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
  • 14 octobre : Première réunion de toute l'équipe CSTB
  • 7 octobre : Première réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB