Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

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'''TITRE DE LA THÈSE :''' Nouvelles stratégies de séquençage basées sur la combinaison de méthodes de séquençage par lectures longues et courtes pour des applications cliniques
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'''TITRE DE LA THÈSE :''' Nouvelles méthodes d’évaluation des variations génétiques via une approche bioinformatique : application aux maladies humaines.
  
'''RESPONSABLES DE LA THÈSE :''' POCH Olivier / THOMPSON Julie
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'''RESPONSABLES DE LA THÈSE :''' POCH Olivier
  
 
'''ECOLE DOCTORALE DE RATTACHEMENT:''' École doctorale des sciences de la vie et de la santé - ED 414
 
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'''ÉQUIPE D’ACCUEIL DE LA THÈSE :''' Complex Systems and Translational Bioinformatics - ICube (UMR7357)
 
'''ÉQUIPE D’ACCUEIL DE LA THÈSE :''' Complex Systems and Translational Bioinformatics - ICube (UMR7357)
  
'''MOTS CLÉS :''' bioinformatique, Next-Generation-Sequencing, long-read sequencing
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'''MOTS CLÉS :''' Bioinformatique, genetic variations, big data, artificial intelligence
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== '''Publications''' ==
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* Kirsley Chennen*, '''Thomas Weber'''*, Xavière Lornage, Arnaud Kress, Johann Böhm, Julie Thompson, Jocelyn Laporte, et Olivier Poch. 2020. « MISTIC: A Prediction Tool to Reveal Disease-Relevant Deleterious Missense Variants ». PLoS ONE 15 (7): e0236962. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0236962. (* : equal contribution)
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* New sequencing strategies for clinical applications based on the combination of Long and Short read Sequencing - '''Weber T.''', Chennen K and Poch O. – Eurolife winter school 2018 (Obergurgl, Autriche)
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* MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - '''Weber T.''', Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - Journées du Campus d’Illkirch, 19 avril 2021 (Illkirch, France)
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* MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - '''Weber T.''', Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, 6-9 juillet 2021 (Paris, France)
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* MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - '''Weber T.''', Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - 12ème édition Young Researchers in Life Sciences, 16-18 juin 2021 (Paris, France)
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* MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - '''Weber T.''', Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - Data Science and Artificial Intelligence workshop, 7 novembre 2019 (Strasbourg, France)
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=== '''Posters''' ===
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* '''MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - IGBMC-FMI Graduate student symposium, 26-29 avril 2021 (Illkirch, France)''' '''(best poster award)'''
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* MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - '''Weber T.''', Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - 8èmes journées de la FMTS, 22 avril 2021 (Strasbourg, France)
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* MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - '''Weber T.''', Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. – Colloque fondation maladies rares, 28 février 2020 (Strasbourg, France)
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* MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - '''Weber T.''', Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - Doctoral School Days, 21-22 avril 2021 (Strasbourg, France)
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== '''Contact & Visibilité''' ==
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E-mail: ''thomas.weber@unistra.fr''
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GitHub: [https://github.com/weber8thomas weber8thomas]
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ORC-iD : [https://orcid.org/0000-0002-0807-6363 0000-0002-0807-6363]
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LinkedIn : [https://www.linkedin.com/in/weber-thomas/ weber-thomas]
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Twitter : [https://twitter.com/weber8thomas weber8thomas]
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Google Scholar : [https://scholar.google.com/citations?user=-CKxuxQAAAAJ&hl=fr&oi=sra Weber Thomas]

Version actuelle datée du 15 octobre 2021 à 10:20

Thèse

TITRE DE LA THÈSE : Nouvelles méthodes d’évaluation des variations génétiques via une approche bioinformatique : application aux maladies humaines.

RESPONSABLES DE LA THÈSE : POCH Olivier

ECOLE DOCTORALE DE RATTACHEMENT: École doctorale des sciences de la vie et de la santé - ED 414

ÉQUIPE D’ACCUEIL DE LA THÈSE : Complex Systems and Translational Bioinformatics - ICube (UMR7357)

MOTS CLÉS : Bioinformatique, genetic variations, big data, artificial intelligence

Publications

  • Kirsley Chennen*, Thomas Weber*, Xavière Lornage, Arnaud Kress, Johann Böhm, Julie Thompson, Jocelyn Laporte, et Olivier Poch. 2020. « MISTIC: A Prediction Tool to Reveal Disease-Relevant Deleterious Missense Variants ». PLoS ONE 15 (7): e0236962. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0236962. (* : equal contribution)

Communications

Orals

  • New sequencing strategies for clinical applications based on the combination of Long and Short read Sequencing - Weber T., Chennen K and Poch O. – Eurolife winter school 2018 (Obergurgl, Autriche)
  • MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - Journées du Campus d’Illkirch, 19 avril 2021 (Illkirch, France)
  • MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, 6-9 juillet 2021 (Paris, France)
  • MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - 12ème édition Young Researchers in Life Sciences, 16-18 juin 2021 (Paris, France)
  • MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - Data Science and Artificial Intelligence workshop, 7 novembre 2019 (Strasbourg, France)

Posters

  • MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - IGBMC-FMI Graduate student symposium, 26-29 avril 2021 (Illkirch, France) (best poster award)
  • MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - 8èmes journées de la FMTS, 22 avril 2021 (Strasbourg, France)
  • MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. – Colloque fondation maladies rares, 28 février 2020 (Strasbourg, France)
  • MISTIC: A prediction tool to reveal disease-relevant deleterious missense variants - Weber T., Chennen K., Lornage X., Kress A., Böhm J., Thompson J., Laporte J., and Poch O. - Doctoral School Days, 21-22 avril 2021 (Strasbourg, France)

Contact & Visibilité

E-mail: thomas.weber@unistra.fr

GitHub: weber8thomas

ORC-iD : 0000-0002-0807-6363

LinkedIn : weber-thomas

Twitter : weber8thomas

Google Scholar : Weber Thomas