Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

Différences entre les versions de « Pierre Collet »

De Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle
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[[Fichier:Pierre_Collet_2022.jpg|120px]]<br>[[en:Pierre_Collet|--- English page ---]]
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Professeur (enseignant-chercheur) en informatique détaché à compter du 1er février 2024 à l'Institut de Technologie pour l'Innovation en Santé et Bien-être ([https://itisb.cl/ ITISB]) de l'Université Andrés Bello à Viña del Mar, Valparaiso, Chili.<br>
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Ma nouvelle page web à compter du 1er février 2024 se trouve maintenant [https://itisb.cl/nosotros ici].
  
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Jusqu'au 31 janvier 2024, Pierre Collet était :<br>
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Professeur (enseignant-chercheur) en informatique :
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* Enseignant au département d'Informatique de [https://mathinfo.unistra.fr/ l'UFR Mathématique et Informatique de l'Université de Strasbourg],
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* Chercheur au laboratoire [http://icube.unistra.fr ICUBE (Laboratoire des sciences de l'Ingénieur, de l'Informatique et de l'Imagerie de l'[http://www.unistra.fr Université de Strasbourg], Unité Mixte de Recherche CNRS 7357).
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* Promu à la Classe Exceptionnelle depuis le 01/09/2016, 2ème échelon depuis le 01/09/2019.
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* Prime d'Enseignement Doctoral et de Recherche (PEDR en 2005, PES en 2010, PEDR en 2015, PEDR en 2021)
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* Ancien directeur du Département d'Informatique de l'UFR Mathématique et Informatique de l'Université de Strasbourg (2011-2015).<br><br>
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__TOC__
  
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==Etudes à l'étranger, propositions de stages==
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* [[Renseignements pour effectuer des études à l'étranger (Erasmus, ...)]]
  
[[image:Collet.jpg|120px]]<br>[[en:Pierre_Collet|--- English page ---]]
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* Anciens sujets:
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**[[RADAR (Robust Anonymous DAta Records]]
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**[[Spectrométrie de Masse]]
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**[[Analyse et de la prévision de demande en énergie]] (financement Électricité de Strasbourg)
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**[[Réalité Augmentée du réseau électrique souterrain]] (financement Électricité de Strasbourg)
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**[[Gestion Big Data de consommation d'énergie pour plusieurs centaines de milliers de sites]] (financement Électricité de Strasbourg)
  
<b><center>[[Poste de Maître de Conférences en 27è section pour la rentrée 2016-17]]</center></b>
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*Stage d'été (2 à 3 mois) :
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**[[Parallélisation sur GPU de calcul pour la chimie]]
  
* Professeur en informatique, au [http://icube.unistra.fr Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie] de l'[http://www.unistra.fr Université de Strasbourg], Unité Mixte de Recherche CNRS 7357.
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*[[Anciens stages]]
* Co-coordinateur (avec le Pr Cyrille Bertelle, de l'Université du Havre) de l'[http://unitwin-cs.org UniTwin CS-DC de l'UNESCO] présidé par Paul Bourgine
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* Coordinateur de [https://en.wikiversity.org/wiki/Portal:Complex_Systems_Digital_Campus/E-Laboratory_on_complex_computational_ecosystems ECCE] (E-lab on Complex Computational Ecosystems).
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==A quoi sert la science ?==
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* [http://www.franceculture.fr/emission-dernieres-nouvelles-de-l-univers-la-culture-scientifique-2013-09-01 Une merveilleuse réponse par André Brahic].
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* [[Pourquoi la biodiversité est essentielle pour l'homme]] ?
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* [[Les animaux et les plantes sont intelligents]] !
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* [[À quoi sert la recherche fondamentale]] ?
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== Responsabilités actuelles ==
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<span style="font-size:116%">'''Administratives'''</span>
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* Co-responsable (avec [[Olivier Poch]]) de l'équipe [http://http://icube-cstb.unistra.fr/ Systèmes Complexes et Bioinformatique Théorique] créée au 1er janvier 2016.
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* Expert pour l'Université Franco-Azerbaidjanaise [http://ufaz.ae UFAZ] (co-créée avec Jean-Marc Planeix, Philippe Turek et Eckart Hötzel en septembre 2016, sous l'égide d'Alain Beretz puis Michel Deneken)
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* Co-fondateur et co-coordinateur (avec le Pr Cyrille Bertelle, de l'Université du Havre et Paul Bourgine, Président) de l'[http://cs-dc.org UniTwin CS-DC de l'UNESCO], un réseau de 130 universités dans 38 pays dont l'objectif est de développer la nouvelle science des Systèmes Complexes par l'éducation et la recherche. Le CS-DC est donc très similaire à une grande université internationale. Il a été validé par Irina Bokova, Directrice Générale de l'UNESCO en juillet 2014. Le président du CS-DC est Paul Bourgine.
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* Directeur du Réseau National des Systèmes Complexes (RNSC), Groupement d'Intérêt Scientifique (GIS) depuis novembre 2017.
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* Correspondant Relations Internationales du Département d'Informatique de l'UFR Mathématique et Informatique depuis sept. 2016
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* Membre du bureau et du conseil de l'UniTwin Complex Systems Digital Campus de l'UNESCO depuis juillet 2014
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* Coordinateur de [https://en.wikiversity.org/wiki/Portal:Complex_Systems_Digital_Campus/E-Laboratory_on_complex_computational_ecosystems ECCE] (e-laboratoire international sur les écosystèmes de calcul complexes) depuis juillet 2015.
 
* Coordinateur du [http://cnsc.unistra.fr Campus Numérique des Systèmes Complexes] de l'Université de Strasbourg depuis mai 2012.
 
* Coordinateur du [http://cnsc.unistra.fr Campus Numérique des Systèmes Complexes] de l'Université de Strasbourg depuis mai 2012.
* Directeur du département d'informatique de l'UFR Maths-Info de l'Université de Strasbourg[[page di|.]] depuis juillet 2011.
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* Membre du comité des sages de l'Association Evolution Artificielle depuis 2008.
* Membre de l'Executive Committee et du Conseil de la Complex Systems Society
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* Membre du comité directeur des conférences EuroGP depuis 2005.
* Membre du Board du Complex Systems Digital Campus (UniTwin UNESCO)
 
* Responsable de la thématique [[Evolution artificielle, optimisation et apprentissage]] (SONIC : Stochastic Optimisation and Nature Inspired Computing) de l'équipe [http://lsiit.u-strasbg.fr/bfo BFO].
 
* Reponsable de l'équipe [http://lsiit.u-strasbg.fr/bfo BFO] (Bioinformatique théorique, Fouille de données et Optimisation stochastique) de 2007 à 2012.
 
* Responsable du comité "Computing Ecosystem" et membre du comité "Educational Ecosystem" du [http://unitwin.csregistry.org/tiki-index.php?page=HomePage CS-DC] (Campus International des Systèmes Complexes)
 
* Membre du conseil de la [http://cssociety.org/ Complex Systems Society] de 2012 à 2014, responsable du WorkGroup CERE (Computational Ecosystem for Research and Education) de l'[http://unitwin-cs.org/ UniTwin UNESCO sur les Systèmes Complexes].
 
* Pr&eacute;sident de l'Association [http://ea.inria.fr Evolution Artificielle] de 2003 à 2008 (après en avoir été le trésorier de 1999 à 2003).
 
 
* Membre du comité directeur des conférences internationales sur l'Evolution Artificielle (organisées par l'association Evolution Artificielle) depuis 2001.
 
* Membre du comité directeur des conférences internationales sur l'Evolution Artificielle (organisées par l'association Evolution Artificielle) depuis 2001.
* Membre du comité directeur des conférences EuroGP depuis 2005.
 
* Fondateur et organisateur des 2 premières écoles d'été françaises sur l'Evolution Artificielle à Yravals en 2006 et 2007.
 
* Expert pour l'Agence Nationale pour la Recherche (ANR) française, pour l'[http://www.epsrc.ac.uk/default.htm Engineering and Physical Sciences Research Council] (EPSRC) britannique, pour le comité ECOS-Sud, pour les Conseils Régionaux, ...
 
* <i>Associate Editor</i> du [http://www.hindawi.com/journals/jaea Journal of Artificial Evolution and Applications] (Stefano Cagnoni, éditeur en chef) depuis janvier 2007.
 
* Membre de l'<i>International Advisory Board</i> de la 25è [http://www.scs-europe.net/conf/ecms2011/index.html European Conference on Modelling and Simulation].
 
* Nombre d'Erdös de 3 grâce à Pierre Liardet, décédé en Août 2014. Pierre était un grand mathématicien, très ouvert, qui répondait toujours présent lorsqu'on le sollicitait.
 
  
Organisation de manifestations / conf&eacute;rences :
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<span style="font-size:116%">'''Scientifiques'''</span>
* [http://cs-dc.org/CS-DC-15 CS-DC'15] : Président du Comité d'Organisation de la première e-conférence mondiale sur les Systèmes Complexes, sept-oct 2015, Phoenix, Arizona.
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* Co-responsable (avec [[Julie Thompson]] de la thématique [[BIONICS (Biology and Nature Inspired Complex Systems)]] de l'équipe CSTB depuis janvier 2016
* [http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/conferences/BioinformaticsEurope2015London.pdf Bioinformatics Europe 2015 London] : Animateur de la table ronde ''Large scale computing tasks using cloud and mobile resources''.
+
* Responsable scientifique du [http://poem.unistra.fr Projet POEM]
* Co-chair avec [http://cptra.ln.edu.hk/staffProfile/mlwong.htm Man Leung Wong] du track ''Parallel Evolutionary Systems'' de la conférence GECCO'11 à Dublin.
+
* Responsable scientifique du [http://easea.unistra.fr Projet EASEA CLOUD]
* Guest Editor avec [http://cptra.ln.edu.hk/staffProfile/mlwong.htm Man Leung Wong] d'un numéro spécial du journal international Springer ''Genetic Programming and Evolvable Machines'' intitulé ''Evolutionary Algorithms for Data Mining'', à paraître (cf. [http://gpemjournal.blogspot.com/2010/07/cfp-special-issue-on-evolutionary.html cfp]).
+
* Responsable scientifique du [http://hope.unistra.fr Projet HOPE]
* Chairman de la session ''Evolutionary Multiobjective Optimization'' de la conférence [http://www.sigevo.org/gecco-2010/ GECCO'10] à Portland.
+
* Responsable scientifique du [http://
* Animation du tutoriel ''Evolutionary Computation on GPUs'' avec [http://web.cs.mun.ca/~banzhaf/ Wolfgang Banzhaf] et [http://www.evolutioninmaterio.com/ Simon Harding] de la conférence [http://www.sigevo.org/gecco-2010/ GECCO'10] à Portland.
 
* [https://lsiit.u-strasbg.fr/ea09/index.php/Main_Page EA'09] : Président de la 9ème Conférence Internationale sur l'Evolution Artificielle, oct 2009, Strasbourg.
 
* Conférencier invité de la conférence [http://kaeiog.elka.pw.edu.pl/index.php?page=index Algorytmy Ewolucyjne i Optymalizacja Globalna]'09 à Zawoja, Pologne.
 
* Co-organisateur de la 8&egrave;me Conf&eacute;rence Internationale sur l'Evolution Artificielle ([http://ea07.hant.li.univ-tours.fr EA'07]) &agrave; Tours, octobre 2007.
 
* Organisateur de la deuxi&egrave;me &eacute;cole d'&eacute;t&eacute; sur l'Evolution Artificielle</a> &agrave; Yravals en mai 2007.
 
* <i>Chairman</i>, avec [mailto:vmasero@unex.es Valentin Masero] du track <i>Computer Applications in Health Care</i> ([http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/cahc07/SAC_CAHC_07.html CAHC'07]) du  22&egrave;me; <i>Symposium on Applied Computing</i> de l'[http://www.acm.org ACM] ([http://www.acm.org/conferences/sac/sac2007/ SAC'07]) &agrave; S&eacute;oul (Cor&eacute;e du sud), mars 2007.
 
*  Organisateur de la  [http://www-lil.univ-littoral.fr/~fonlupt/yravals/index.html première école d'été sur l'Evolution Artificielle] &agrave; Yravals en juin 2006.
 
* <i>Programme Chair</i>, avec [http://www-iis.unil.ch/membres/mtomassi.html Marco Tomassini] de la 9&egrave;me conf&eacute;rence internationale sur la programmation g&eacute;n&eacute;tique  [http://www.evonet.info/eurogp2006/ EURO-GP'06] &agrave;    Budapest (Hongrie).
 
* <i>Chairman</i>, avec    [mailto:vmasero@unex.es Valentin Masero] du track <i>Computer Applications in Health Care</i> ([http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/SAC06CAHC.html CAHC'06]) du    21&egrave; <i>Symposium on Applied Computing</i> de l'[http://www.acm.org ACM] ([http://www.acm.org/conferences/sac/sac2006/ SAC'06])  &agrave; Dijon (France).
 
* Co-organisateur des Conf&eacute;rences Internationales        [http://www.lifl.fr/EA2005/ EA'05] (Lille) et [http://ea.inria.fr/ea03 EA'03] (Marseille).
 
* <i>Publication Chair</i> de la 8&egrave; conf&eacute;rence  internationale sur la programmation g&eacute;n&eacute;tique  [http://www.evonet.info/eurogp2005/ EURO-GP'05] &agrave;    Lausanne (Suisse).
 
*Pr&eacute;sident de la 5&egrave;me Conf&eacute;rence Internationale sur    l'Evolution Artificielle ([http://www.cmap/polytechnique.fr/~ea01/ EA'01]) au Creusot (France).
 
* Co-organisateur des  [http://www-lil.univ-littoral.fr/~fonlupt/JET15 JETs] (Journ&eacute;es &Eacute;volutionnaires Trimestrielles) 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17.
 
 
... et ici, une un peu trop longue [[biographie de Pierre Collet]].<br><br>
 
  
==Propositions de projets ou stages pour 2015-16 ==
+
==Enseignement==
 +
* MOOC OSÉ et IASC
 +
* Cours
 +
** [[Articles Introduction à la Recherche | Introduction à la Recherche L3]],
 +
** [[Support de cours CPI | Culture et Pratique de l'Informatique L1]],
 +
** Intelligence Artificielle L3,
 +
** Evolution Artificielle,
 +
** Syst&egrave;mes d'exploitation et architecture des ordinateurs,
 +
** Algorithmique,
 +
** langages C, C++, Java.
 +
** [[media:PratiqueDesSystemes.pdf|Pratique des Systèmes d'Exploitation]]
 +
** [[media:FondementDesSystemes.pdf|Fondements des Systèmes d'Exploitation]]
 +
** [[media:Alinea.pdf|Algèbre Linéaire Appliquée]]
 +
** [[PC_-_Anglais_Scientifique|Anglais scientifique]]
 +
* Documents généraux
 +
** [[media:tdVim.pdf|Commencer avec vi]].
 +
** [[media:initLaTeX.pdf|Commencer avec LaTeX]] [http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/stages/initLaTeX.tgz (tarball à détarer dans un répertoire)].
 +
* Responsable du [http://dess-icc.univ-littoral.fr MASTER CCI](Comp&eacute;tence Compl&eacute;mentaire en Informatique) de l'ULCO de 2003 &agrave; 2006.
  
* [[Évaluation Pair à Pair Participative pour l'enseignement numérique]]
+
==Recherche==
* [[Développement d'algorithmes bio-inspirés pour la sécurité]]
+
<span style="font-size:132%">'''Domaines de recherche'''</span>
* [[Système d'intelligence sociale participative basé sur des interactions stigmergiques]]
+
<ul>
* [[Utilisation d'algorithmes de programmation génétique en biologie synthétique]]
+
<li> Intelligence Artificielle Éthique, Autonome et Explicable (XEA-AI).
* [[Données numériques robustes diluées dans un système complexe]]
+
<li> Optimisation de probl&egrave;mes complexes par
 +
algorithmes stochastiques inspir&eacute;s de la nature.
 +
<li> Parallélisation des algorithmes évolutionnaires sur clusters parallèles et cartes massivement parallèles de type GPGPU (General Purpose Graphic Processing Units).
 +
</ul>
 +
<li> Applications : fouille de donn&eacute;es en bio-informatique,
 +
optimisation du param&eacute;trage d'implants cochl&eacute;aires,
 +
optimisation de parcours p&eacute;dagogiques, recherche en automates
 +
cellulaires, ...
 +
<li>Sp&eacute;cialiste en :
 +
  <ul>
 +
    <li>Systèmes Complexes,
 +
    <li> Systèmes à base de règles, systèmes de classeurs,
 +
    <li>Programmation G&eacute;n&eacute;tique,
 +
    <li>Algorithmes &eacute;volutionnaires (algorithmes
 +
        g&eacute;n&eacute;tiques, strat&eacute;gies d'&eacute;volution, et
 +
        autres paradigmes connexes),
 +
    <li>Algorithmes &eacute;volutionnaires interactifs,
 +
    <li>Optimisation par essaim particulaire et par colonies de fourmis (OCF).
 +
    <li>&Eacute;mergence (parall&eacute;lisme au niveau des donn&eacute;es,
 +
    agents autonomes, ...).
 +
    <li>Systèmes éducatifs intelligents.
 +
    <li>Chirurgie Assistée par Ordinateur.
 +
    <li>Avionique et mécanique du vol.
 +
  </ul>
  
([[Anciens projets]])
+
<span style="font-size:132%">'''Projets majeurs (et plateformes)'''</span>
  
==A quoi sert la science ?==
+
<span style="font-size:116%">'''POEM (Personalised Open Education for the Masses)'''</span>
*Une merveilleuse réponse par [http://www.franceculture.fr/emission-dernieres-nouvelles-de-l-univers-la-culture-scientifique-2013-09-01 André Brahic].
 
*Des [[exemples d'application de la recherche fondamentale]] par René Trégouët, Sénateur, rapporteur de la Recherche et Président/fondateur du Groupe de Prospective du Sénat, extraits de son très bel [http://www.rtflash.fr/mystere-eternel-monde-est-qu-il-soit-comprehensible-cela-tient-miracle-albert-einstein/article éditorial de février 2016] suite à la [http://journals.aps.org/prl/abstract/10.1103/PhysRevLett.116.061102 détection d'ondes gravitationnelles par les équipes LIGO et VIRGO le 11 février 2016].
 
  
==Recherche==
+
<span style="font-size:116%">'''EASEA CLOUD'''</span>
===Projets majeurs (et plateformes)===
 
====POEM (Personalised Open Education for the Masses)====
 
130k€
 
 
 
====EASEA (et EASEA-CLOUD)====
 
 
Thèses et projets de recherche réalisés (à ma connaissance) avec (et sur) EASEA :
 
Thèses et projets de recherche réalisés (à ma connaissance) avec (et sur) EASEA :
 
<ul>
 
<ul>
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<li> Philippe Guermeur, ''Vision robotique monoculaire : reconstruction du temps avant collision et de l'orientation des surfaces à partir de l'analyse de la déformation,'' Université de Rouen, octobre 2002.
 
<li> Philippe Guermeur, ''Vision robotique monoculaire : reconstruction du temps avant collision et de l'orientation des surfaces à partir de l'analyse de la déformation,'' Université de Rouen, octobre 2002.
 
</ul>
 
</ul>
====HEVEA (Étude et Valorisation de lÉcologie Auditive)====
+
<span style="font-size:116%">'''HEVEA (Étude et Valorisation de l'Écologie Auditive)'''</span>
 
Responsable Scientifique du projet RNTS (Projet Hospitalier de Recherche Clinique) HEVEA (130k€, Sept 05 - Sept 06) : expérimentation sur 10 patients d'un réglage d'implant cochléaire par algorithme évolutionnaire interactif.
 
Responsable Scientifique du projet RNTS (Projet Hospitalier de Recherche Clinique) HEVEA (130k€, Sept 05 - Sept 06) : expérimentation sur 10 patients d'un réglage d'implant cochléaire par algorithme évolutionnaire interactif.
====Bio-Inspired Classification and Data-Mining Algorithms for Bioinformatics====
+
<span style="font-size:116%">'''Bio-Inspired Classification and Data-Mining Algorithms for Bioinformatics'''</span>
 
Porteur du projet européen Interreg IIIa 182b Bio-Inspired Classification and Data-Mining Algorithms for BioInformatics avec l'Université du Kent à Canterbury (379 KEuros, Sept 06 - Août 07).
 
Porteur du projet européen Interreg IIIa 182b Bio-Inspired Classification and Data-Mining Algorithms for BioInformatics avec l'Université du Kent à Canterbury (379 KEuros, Sept 06 - Août 07).
====Emergence of Computation in Cellular Automata====
+
<span style="font-size:116%">'''Emergence of Computation in Cellular Automata'''</span>
 
Responsable français du projet anglais EPSRC Emergence of Computation in Cellular Automata, EP/D066174/1 avec Andrew Adamatsky, de l'UWE-Bristol (137 KEuros, Sept 06 - Oct 07).
 
Responsable français du projet anglais EPSRC Emergence of Computation in Cellular Automata, EP/D066174/1 avec Andrew Adamatsky, de l'UWE-Bristol (137 KEuros, Sept 06 - Oct 07).
====Magellan====
+
<span style="font-size:116%">'''Magellan'''</span>
 
Responsable scientifique du projet Magellan (1,7 MF, Sept 93 - Sept. 98) de Création d'un prototype fonctionnel de Chirurgie Assistée par Ordinateur pour l'ORL. Projet financé par l'Institut Électricité Santé (EDF), la Fondation de l'Avenir, l'APHP.
 
Responsable scientifique du projet Magellan (1,7 MF, Sept 93 - Sept. 98) de Création d'un prototype fonctionnel de Chirurgie Assistée par Ordinateur pour l'ORL. Projet financé par l'Institut Électricité Santé (EDF), la Fondation de l'Avenir, l'APHP.
  
===Publications===
+
[[Anciens projets]]
 +
 
 +
<span style="font-size:132%">'''Publications'''</span>
 
* [http://icube-publis.unistra.fr/appli.php?author=Pierre+Collet&title=&team=toutes&annee1=&annee2=&nationalRank=toutes&project=tous Liste des publications]
 
* [http://icube-publis.unistra.fr/appli.php?author=Pierre+Collet&title=&team=toutes&annee1=&annee2=&nationalRank=toutes&project=tous Liste des publications]
 +
* Nombre d'Erdös de 3 grâce à la publication d'un livre avec Pierre Liardet, décédé en Août 2014. Pierre était un grand mathématicien, très ouvert, qui répondait toujours présent lorsqu'on le sollicitait.
 
* [[Livres]]
 
* [[Livres]]
 +
* Editeur en chef, avec [mailto:evelyne.lutton@inria.fr Evelyne Lutton], d'un numéro double sur l'[http://www.lavoisier.fr/notice/fr2746216280.html Evolution Artificielle] du journal TSI (Lavoisier), Janvier 2007.
 +
* Auteur du langage [http://sourceforge.net/projects/easea EASEA] (<i>EAsy Specification of Evolutionary Algorithms</i>)
 +
<span style="font-size:116%">'''Prix et distinctions'''</span>
 +
<ul>
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<li> Best Paper Award de la conférence EvoPAR'14 pour le papier :  [http://icube-publis.unistra.fr/papr/2014/4-LGCB14  E. Lutton, H. Gilbert, W. Cancino, B. Bach, P. Parrend, P. Collet, ''Visualisation of Island-Based Parallel Genetic Algorithms'', EVOPar, Granada, Espagne, Springer, LNCS, avril 2014]
 +
<li> Prix de la compétition [http://www.gpgpgpu.com/gecco2012/ GPUs for Genetic and Evolutionary Computation] de la conférence mondiale GECCO’12 pour le papier P. Collet, F. Krüger, O. Maitre, ''GECCO 2012 GPGPU competition: The EASEA parallelization platform'', Gecco 2012, Philadelphia
 +
</ul>
 +
 +
==diffusion scientifique==
 +
<span style="font-size:116%">'''Keynotes'''</span>
 +
 +
<gallery>
 +
File:AC.png|[https://www.youtube.com/watch?v=UJXd7sp6SmA TedX '''Shape the Future''' en anglais à Troyes, sur les ordinateurs autonomes]
 +
File:CS.png|[https://prezi.com/98gzlhkhhdfu Les Systèmes Complexes (en français)]
 +
File:CS.png|[https://prezi.com/sfp5jeysl8xt Les Systèmes Complexes (en anglais)]
 +
File:POEM.png|[https://prezi.com/pcmbojxnbypc POEM (Personalised Open Education for the Masses) en français]
 +
</gallery>
 +
* Biowin days
 +
* ICAMMP - IV
 +
* ''Évolution, évolution artificielle et diversité'', Clôture du Colloque Biodiversité et Résilience, 12 - 14 octobre 2015, Institut des Systèmes Complexes Paris Île-de-France.
 +
* "Influence de la cyberscience sur la vie de l’homme et sa vision du monde", [http://espacesdialogues.org/event/colloque-xxie-siecle-une-nouvelle-renaissance/ Colloque XXIè siècle, une nouvelle renaissance ?], 21/06/2014 ([http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/keynotes/TranscriptionColloqueXXIeSiecleUneNouvelleRenaissance transcription])
 +
* ''Les Systèmes Complexes : une nouvelle science intégrative et prédictive pour une Santé 4P'', conférence de clôture du [http://www.asc.sn/congresDakar2013/ 7è Congrès Francophone Mondial de Chirurgie] à Dakar, Sénégal, 6/12/13
 +
* [[media:AfficheTaiwan0513.pdf|''Personalised Open Education for the Masses'']], 2013 International Conference Future Earth Science Learning Embedded with Emerging Technologies International Conference, Taiwan Normal University, 17/05/13
 +
* ''Towards Inventive Computers thanks to Artificial Evolution'', Triz Future 2012, Portugal.
 +
* 2/06/2009: Keynote de la conférence [http://kaeiog.elka.pw.edu.pl/index.php?page=index Algorytmy Ewolucyjne i Optymalizacja Globalna'09] à Zawoja, Pologne : ''Artificial Evolution algorithms can use GPGPUs''
 +
 +
<span style="font-size:116%">'''Conférences invitées'''</span>
 +
 +
* Terrasses du Numérique
 +
* Diversité en biologie
 +
 +
<span style="font-size:116%">'''Séminaires'''</span>
 +
* VUB
 +
*[https://my.vub.ac.be/nieuws/ecco-seminar-personalised-open-education-masses-poem ECCO Seminar: Personalised Open Education for the Masses (POEM), Vrije Universiteit Brussel] 11/04/2014
 +
*[https://who.rocq.inria.fr/Gilles.Dowek/MoocLab/13janvier/collet.pptx ''POEM : Personalised Open Education for the Masses''], Séminaire Mooc-lab INRIA [https://who.rocq.inria.fr/Gilles.Dowek/MoocLab/13janvier/ Moocs : de la correction automatique à la personnalisation des cursus], Inria, Paris, 13 janvier 2014
 +
*Institut des Systèmes Complexes
  
===Encadrement doctoral et scientifique===
+
<span style="font-size:116%">'''Tutoriels'''</span>
====Encadrement de thèses en cours====
+
* PPSN 2011
 +
* [http://www.sigevo.org/gecco-2010/tutorials.html#ecgpu Computation on GPUs] with W. Banzhaf and S. Harding, Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO 2010
 +
* GECCO 2009
 +
 
 +
<span style="font-size:116%">'''Ecoles d'été'''</span>
 +
* Education numérique à l'X
 +
 
 +
<span style="font-size:116%">'''Articles dans la presse'''</span>
 +
* 15 avril 2018 : Fabien Soyez, [https://www.outthere.fr/stories/evolution-artificielle-ces-chercheurs-preparent-la-prochaine-generation-dia/ Évolution artificielle : ces chercheurs préparent la prochaine génération d’IA]
 +
* 14 mai 2017 : Sophie Fay, [https://www.nouvelobs.com/economie/20170428.OBS8725/les-ordinateurs-peuvent-evoluer-a-la-maniere-darwinienne.html Les ordinateurs peuvent évoluer à la manière darwinienne]
 +
* [https://flipflashpages.uniflip.com/2/61981/375778/pub/document.pdf ''Le physiome humain : les équations du vivant'', Le Spécialiste, p 14, 01/12/2016]
 +
* [http://biovox.be/en/insights/detail/a-new-level-of-science-artificial-evolution-and-complex-systems ''A new level of Science: Artificial Evolution and Complex Systems'', Biovox 27/10/2016]
 +
* [[Dépêche AEF No 190761 du 6/12/13]] (Agence Éducation Formation), rédigée par Pascaline Marion
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* DNA
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* savoirs
 +
 
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<span style="font-size:116%">'''Diffusion logicielle'''</span>
 +
* POEM
 +
* EASEA CLOUD
 +
* HOPE
 +
 
 +
==Encadrement doctoral et de recherche==
 +
<span style="font-size:116%">'''Direction / co-direction / encadrement / co-encadrement de thèses en cours'''</span>
 
<ul>
 
<ul>
<li> Pierre Masai (Oct 14 -) "LEAN as a Complex System"
+
<!-- <li> Alexandra Fronville (thèse d'HDR) "De la contrainte à l’émergence : comprendre la morphogenèse par la matrice extra-cellulaire"-->
<li> Fabio Guigou (Dec 14 -) "Gestion sécurisée des accès à des ressources virtuelles au sein d'environnements distribués par système immunitaire artificiel"
+
<li> Léo Chéneau (démarrage en cours : thèse CIFRE IBM sur l'évolution de circuits quantiques pour en minimiser le bruit)
<li> Renaud Vanhoutrève (oct 13 -) ''Alignement de séquences protéiques pour une analyse de données NGS appliquée à la Santé'' en co-direction avec Julie Thompson, LBGI
+
<li> Tam'si Ley (01/11/2021, 50% avec Johannes Schachenmayer) "Resource estimation for practical quantum computing"
<li> Jean Meunier (dec 13 -) ''Modélisation et optimisation d’un système de gestion énergétique pour bâtiments, intégrant la production photovoltaïque et le stockage par batteries'', en co-direction avec Dominique Knittel (LGeCo).
+
<li> Lalla-Aïcha Koné (01/11/2020, 75% avec Ahmedou Haouba) "Aide à la décision à partir de motifs extraits de données massives pour l’amélioration du service public"
 +
<li> Yohan Solon (15/11/2020, 75% avec Ecaterina Pacurar) "Efficacité de l'inter-tutorat en contexte d'une pédagogie de masse personnalisée"
 
</ul>
 
</ul>
  
====Thèses soutenues (en tant que directeur ou co-directeur ou encadrant ou co-encadrant)====
+
<span style="font-size:116%">'''Thèses soutenues (en tant que directeur / co-directeur / garant / encadrant / co-encadrant)'''</span>
 
<ul>
 
<ul>
<li> Igor Santos Peretta (oct 12 - nov 15) ''Evolution of an integrated model for a complex system through massively parallel Genetic Programming'', en co-direction avec Keiji Yamanaka, Uberlandia, Brasil.
+
<li> Hiba Khodji (01/11/2020 avec Julie Thompson, encadrement Anne Jeannin-Girardon) "Caractérisation de la transférabilité des représentations latentes des réseaux neuronaux profonds pour la détection d’erreurs dans la prédiction de séquences de gènes" soutenue à l'Université de Strasbourg le 7 novembre 2023
<li> Cécilia Zanni-Merk (11/13 - 11/14) thèse d'Habilitation à Diriger les Recherches) "Knowledge Technologies for Problem Solving in Engineering", garant : Pierre Collet, soutenue le 20 novembre 2014 à l'Université de Strasbourg
+
<li> Corentin Meyer (01/10/2020, 50% avec Olivier Poch) « MYO-xIA : IA explicable pour la classification intégrée et la prédiction des myopathies congénitales » Projet Artic, soutenue à l'Université de Strasbourg le 20 octobre 2023
<li> Stéphane Querry (02/10 - 09/14) ''Control and modelling of autonomous aircrafts by evolutionary computing'', thèse confidentielle Polyvionics, sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 29 septembre 2014 à l'Université de Strasbourg
+
<li> Romain Orhand (Oct 2018 - Nov 2022), 50% avec Pierre Parrend) "Développement d'ordinateurs autonomes combinant évolution artificielle et intelligence artificielle", soutenue à Strasbourg le 10 novembre 2022
 +
<li> Anne Jeannin-Girardon (thèse d'HDR) "Vers une Intelligence Artificielle Autonome, Explicable et Éthique : alliance entre approches ontologiques et législatives", soutenenue à Strasbourg le 9 novembre 2022
 +
<li> Anna Ouskova (Août 2018 -  Mai 2022, 50% avec Pierre Parrend) "Optimisation évolutionnaire de systèmes de réfrigération magnétique utilisant des alliages magnétocaloriques" soutenue à Strasbourg le 24/05/2022.
 +
<li> Nicolas Scalzitti (Oct 19 - Sept 21) "Nouvelle stratégie d'annotation des génomes par l'utilisation d'algorithmes d'intelligence artificielle" (co-dirigée à 50% avec Julie Thompson), thèse de l'Université de Strasbourg en partie financée par fondation [https://bioniria.org/ Bioniria], soutenue le 29 septembre 2021 à l'Université de Strasbourg.
 +
<li> Ulviya Abdulkarimova (Oct 18 - Sept 21) "Sinus-it: an Evolutionary Approach to Harmonic Analysis", (50% avec Christian Rolando), thèse de l'Université de Strasbourg en collaboration avec l'Université de Lille et l'Université Franco-Aserbaïdjanaise (UFAZ) soutenue le 2 septembre 2021 en visioconférence.
 +
<li> Salma Mesmoudi (HDR, Dec 2020) "Résolution de problèmes et intégration de données multi-échelle et multi-source : approche géométrique et dynamiques complexes"
 +
<li> Fabio Guigou (Dec 14 - Juin 19) "The Artificial Immune Ecosystem: a scalable immune-inspired active classifier", co-encadrant : Pierre Parrend, thèse de l'Université de Strasbourg soutenue le 18 juin 2019 à l'Université de Strasbourg
 +
<li> Pierre Parrend (HDR, décembre 2017) ''Emergent Industrial Ecosystems'', Habilitation à Diriger des Recherches de l'Université de Strasbourg soutenue le 12 décembre 2017 à l'ECAM, Strasbourg
 +
<li> Pierre Masai (Oct 14 - Sept 17) "Modeling the lean organization as a complex system", thèse de l'Université de Strasbourg soutenue le 29 septembre 2017 à l'Université de Strasbourg
 +
<li> Igor Santos Peretta (oct 12 - sept 15) ''Evolution of an integrated model for a complex system through massively parallel Genetic Programming'', en co-direction avec Keiji Yamanaka, thèse de l'Université de Strasbourg en co-tutelle avec l'université d'Uberlandia soutenue le 19 septembre 2015 à l'Université d'Uberlandia, Brésil.
 +
<li> Cécilia Zanni-Merk (HDR 11/13 - 11/14 thèse d'Habilitation à Diriger les Recherches) "Knowledge Technologies for Problem Solving in Engineering", garant : Pierre Collet, soutenue le 20 novembre 2014 à l'Université de Strasbourg
 +
<li> Stéphane Querry (09/10 - 09/14) ''Control and modelling of autonomous aircrafts by evolutionary computing'', thèse confidentielle Polyvionics, sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 29 septembre 2014 à l'Université de Strasbourg
 
<li> Wei Yan, (09/10 - 02/14)''Modélisation de (Méta)Connaissances pour la Conception Inventive'', en co-direction avec Denis Cavallucci, LGeCo, co-encadrée par Cécilia Zanni-Merk. soutenue le 7 février 2014 à l'INSA de Strasbourg
 
<li> Wei Yan, (09/10 - 02/14)''Modélisation de (Méta)Connaissances pour la Conception Inventive'', en co-direction avec Denis Cavallucci, LGeCo, co-encadrée par Cécilia Zanni-Merk. soutenue le 7 février 2014 à l'INSA de Strasbourg
 
<li> Frédéric Krüger (10/11 - 02/14), ''Determination of end user power load profiles by parallel evolutionary computing'', sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 17 février 2014 à Électricité de Strasbourg
 
<li> Frédéric Krüger (10/11 - 02/14), ''Determination of end user power load profiles by parallel evolutionary computing'', sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 17 février 2014 à Électricité de Strasbourg
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<li> Olivier Kühn (10/07 - 10/10), ''Methodology for Knowledge-Based Engineering Template Update - Focus on
 
<li> Olivier Kühn (10/07 - 10/10), ''Methodology for Knowledge-Based Engineering Template Update - Focus on
 
Decision Support and Instances Update'', en co-direction avec Parisa Ghodous, thèse financée par la Société Prostep, soutenue le 22 octobre 2010 à l'Université de Strasbourg
 
Decision Support and Instances Update'', en co-direction avec Parisa Ghodous, thèse financée par la Société Prostep, soutenue le 22 octobre 2010 à l'Université de Strasbourg
<li> Grégory Valgiani, ''Développement d'un paradigme d'optimisation par Hommilière et application à l'enseignement par internet'', Université du Littoral Côte d'Opale, thèse financée par la société Paraschool, sous la direction de Pierre Collet, soutenue en novembre 2006.
+
<li> Grégory Valigiani, ''Développement d'un paradigme d'optimisation par Hommilière et application à l'enseignement par internet'', Université du Littoral Côte d'Opale, thèse financée par la société Paraschool, sous la direction de Pierre Collet, soutenue en novembre 2006.
 
<li> Claire Bourgeois-République, ''Plateforme de réglage automatique et adaptatif d'implant cochléaire par algorithme évolutionnaire interactif,'' Université de Bourgogne encadrée par Pierre Collet décembre 2004.
 
<li> Claire Bourgeois-République, ''Plateforme de réglage automatique et adaptatif d'implant cochléaire par algorithme évolutionnaire interactif,'' Université de Bourgogne encadrée par Pierre Collet décembre 2004.
 
<li> Yann Landrin-Schweitzer, ''Algorithmes génétiques interactifs pour le text-retrieval'', thèse de l'Université d'Orsay dirigée par Evelyne Lutton, co-encadrée par Pierre Collet, soutenue en septembre 2003.
 
<li> Yann Landrin-Schweitzer, ''Algorithmes génétiques interactifs pour le text-retrieval'', thèse de l'Université d'Orsay dirigée par Evelyne Lutton, co-encadrée par Pierre Collet, soutenue en septembre 2003.
 
</ul>
 
</ul>
  
====Contrats post-doctoraux====
+
<span style="font-size:116%">'''Contrats post-doctoraux'''</span>
 
<ul>
 
<ul>
 
<li> Alejandro Rinçon Lopez, "Portage de la plateforme EASEA sur le Cloud", projet ANR EASEA-CLOUD, juin 2014 - mars 2015
 
<li> Alejandro Rinçon Lopez, "Portage de la plateforme EASEA sur le Cloud", projet ANR EASEA-CLOUD, juin 2014 - mars 2015
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</ul>
 
</ul>
  
====Encadrement de stages de recherche====
+
<span style="font-size:116%">'''Encadrement de stages de recherche'''</span>
 
<ul>
 
<ul>
 +
<li> Quentin Christoffel, "Détection de l'incertitude d'un modèle d'intelligence artificielle", février 2021 - juillet 2021
 
<li> Thomas Chabin, "Visualisation Scientifique d'algorithmes évolutionnaires distribués", projet ANR EASEA-CLOUD, mars 2014 - mars 2015
 
<li> Thomas Chabin, "Visualisation Scientifique d'algorithmes évolutionnaires distribués", projet ANR EASEA-CLOUD, mars 2014 - mars 2015
 
<li> Frédéric Krüger, ''Recherche de zéolithes par évolution artificielle'', M2 Recherche, mars - sept 2011
 
<li> Frédéric Krüger, ''Recherche de zéolithes par évolution artificielle'', M2 Recherche, mars - sept 2011
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<li> Ariel Tchougang, ''Etude du Context-Aware Crossover en Programmation Génétique'', M2 Recherche, mars 08 - sept 08
 
<li> Ariel Tchougang, ''Etude du Context-Aware Crossover en Programmation Génétique'', M2 Recherche, mars 08 - sept 08
 
</ul>
 
</ul>
====Jurys de thèse====
+
<span style="font-size:116%">'''Jurys de thèse'''</span>
 
<ul>
 
<ul>
 
<li> En tant que Président :
 
<li> En tant que Président :
 
<ul>
 
<ul>
 +
<li> Xin NI, ''Inventive Solutions Retrieval from Patent Documents via Natural Language Processing'', thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Denis Cavallucci, co-encadrée par Ahmed Samet, soutenue le 18 décembre 2021.
 +
<li> Yann hodé, ''Contribution à l'interprétation d'images et vérification de la consistance d'un graph'', thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Aline Deruyver, soutenue le 12 novembre 2018.
 +
<li> Karim el Soufi, ''Study of circular code motifs in nucleic acid sequences'', thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Christian Michel, soutenue le 24 janvier 2017
 
<li> Amir Jaberzadeh, "Simulation of heat transfer and automatic optimization of multiple probes trajectories for pre-operative planning of percutaneous thermoablation interventions", thèse en Informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Caroline Essert, soutenue le 13 février 2015.
 
<li> Amir Jaberzadeh, "Simulation of heat transfer and automatic optimization of multiple probes trajectories for pre-operative planning of percutaneous thermoablation interventions", thèse en Informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Caroline Essert, soutenue le 13 février 2015.
<li> Messaouda Mechelfekh, "L’islam spirituel contemporain au travers d’Internet : interactions, modélisation et prospective", Thèse de doctorat en Langues et littératures étrangères de l'Université de Strasbourg, dirigée par Eric Geoffroy soutenue le 11 septembre 2014.
+
<li> Idriss Aberkane, ''Ballade de la Conscience entre Orient et Occident : une perspective soufie sur la conscience occidentale, connectant ''The Kasidah'' de R. F. Burton et ''The Waste Land'' de T. S. Eliot'', Thèse en Études Méditerranéennes et Littérature Comparée de l'Université de Strasbourg, dirigée par Eric Geoffroy et Patrick Laude, soutenue le 16 juin 2014.
<li> Idriss Aberkane, ''Ballade de la Conscience entre Orient et Occident : une perspective soufie sur la conscience occidentale, connectant '''The Kasidah''' de R. F. Burton et '''The Waste Land''' de T. S. Eliot'', Thèse en Études Méditerranéennes et Littérature Comparée de l'Université de Strasbourg, dirigée par Eric Geoffroy et Patrick Laude, soutenue le 16 juin 2014.
 
 
<li> Jonathan Fréchard, ''Systèmes d'entraînement de bandes flexibles : optimisation multicritère des performances dynamiques par approche évolutionnaire'', Thèse en automatique de l'Université de Strasbourg (INSA) dirigée par Dominique Knittel, soutenue le 2 juillet 2013.
 
<li> Jonathan Fréchard, ''Systèmes d'entraînement de bandes flexibles : optimisation multicritère des performances dynamiques par approche évolutionnaire'', Thèse en automatique de l'Université de Strasbourg (INSA) dirigée par Dominique Knittel, soutenue le 2 juillet 2013.
 
<li> Alexis Bultey, ''Représentation hybride des heuristiques et méta-heuristiques utilisées pour la conception innovante'', INSA de Strasbourg, juin 2009.
 
<li> Alexis Bultey, ''Représentation hybride des heuristiques et méta-heuristiques utilisées pour la conception innovante'', INSA de Strasbourg, juin 2009.
 
<li> Camélia Ignat, ''Improving Statistical Alignment and Translation Using Highly Multilingual Corpora'', INSA de Strabourg, juin 2009.
 
<li> Camélia Ignat, ''Improving Statistical Alignment and Translation Using Highly Multilingual Corpora'', INSA de Strabourg, juin 2009.
<li> Arnaud Quirin
+
<li> Arnaud Quirin, "Images de télédétection  Images hyperspectrales  Intelligence artificielle  Règles de classification  Systèmes de classifieurs", thèse de l'Université Louis Pasteur dirigée par Jerzy Korczak et Massimo Menenti, soutenue en décembre 2005.
 
<li>  
 
<li>  
 
</ul>
 
</ul>
 
<li> En tant que rapporteur :
 
<li> En tant que rapporteur :
 
<ul>
 
<ul>
 +
<li> Marwa BEN M’BAREK, ''Détection de communautés dans les grands réseaux : Application aux réseaux d'interactions de gènes'', Thèse en informatique de l'Université PSL Paris Dauphine, en cotutelle avec l'Université de Tunis El Manar, soutenue à Paris le 14 octobre 2022.
 +
<li> Ahmed Hadj Said, ''Intégration du stockage dans les méthodes de planification des réseaux électriques basse tension'', Thèse en informatique de l'Université Grenoble-Alpes, soutenue le 31 janvier 2018.
 
<li> Idriss Aberkane, "Mind Ergonomy for the Knowledge Economy", Thèse en Gestion de l'Université Paris Saclay Ecole Polytechnique, dirigée par Pierre-Jean Benghozi et Paul Bourgine, soutenue le 3 février 2016.
 
<li> Idriss Aberkane, "Mind Ergonomy for the Knowledge Economy", Thèse en Gestion de l'Université Paris Saclay Ecole Polytechnique, dirigée par Pierre-Jean Benghozi et Paul Bourgine, soutenue le 3 février 2016.
 
<li> Meysam Hashemi, "Modélisation mathématique et simulation numérique de populations neuronales thalamo-corticales dans le contexte de l'anesthésie générale", Thèse en informatique de l'Université de Lorraine, dirigée par Axel Hutt, soutenue le 14 janvier 2016.
 
<li> Meysam Hashemi, "Modélisation mathématique et simulation numérique de populations neuronales thalamo-corticales dans le contexte de l'anesthésie générale", Thèse en informatique de l'Université de Lorraine, dirigée par Axel Hutt, soutenue le 14 janvier 2016.
 
<li> Abdelhamid Zouhair, "Raisonnement à Partir de Cas Dynamique Multi-agent - Application à un Système de Tuteur Intelligent", Thèse en informatique en cotutelle de l'Université du Havre (co-direction Cyrille Bertelle) et de l'Université Abelmalek Essaâdi (Maroc, co-direction Benaissa Amami), soutenue le 20 octobre 2014.
 
<li> Abdelhamid Zouhair, "Raisonnement à Partir de Cas Dynamique Multi-agent - Application à un Système de Tuteur Intelligent", Thèse en informatique en cotutelle de l'Université du Havre (co-direction Cyrille Bertelle) et de l'Université Abelmalek Essaâdi (Maroc, co-direction Benaissa Amami), soutenue le 20 octobre 2014.
 +
<li> Messaouda Mechelfekh, "L’islam spirituel contemporain au travers d’Internet : interactions, modélisation et prospective", Thèse de doctorat en Langues et littératures étrangères de l'Université de Strasbourg, dirigée par Eric Geoffroy soutenue le 11 septembre 2014.
 
<li> Gilian Basso, ''Approche à base d’agents pour l’ingeniérie et le contrôle de micro-réseaux,'' Thèse en Informatique de l'Université de Technologie Belfort-Montbéliard, dirigée par Vincent Hilaire, soutenue le 9 décembre 2013.
 
<li> Gilian Basso, ''Approche à base d’agents pour l’ingeniérie et le contrôle de micro-réseaux,'' Thèse en Informatique de l'Université de Technologie Belfort-Montbéliard, dirigée par Vincent Hilaire, soutenue le 9 décembre 2013.
 
<li> Mathieu Chouchane, ''Optimisation spatio-temporelle d’efforts de recherche pour cibles manoeuvrantes et intelligentes,'' Thèse en Informatique de l'Université d'Aix-Marseille, dirigée par Mustapha Ouladsine et encadrée par Sébastien Paris et François le Gland, soutenue le 17 octobre 2013.
 
<li> Mathieu Chouchane, ''Optimisation spatio-temporelle d’efforts de recherche pour cibles manoeuvrantes et intelligentes,'' Thèse en Informatique de l'Université d'Aix-Marseille, dirigée par Mustapha Ouladsine et encadrée par Sébastien Paris et François le Gland, soutenue le 17 octobre 2013.
Ligne 168 : Ligne 292 :
 
<li>Salma Mesmoudi, ''Conception d'un système informatique mimétique pour résoudre le problème du voyageur de commerce : Application à la cartographie physique du génome'', Université de Tanger, Novembre 2005.
 
<li>Salma Mesmoudi, ''Conception d'un système informatique mimétique pour résoudre le problème du voyageur de commerce : Application à la cartographie physique du génome'', Université de Tanger, Novembre 2005.
 
</ul>
 
</ul>
<li> En tant qu'exminateur :
+
<li> En tant qu'examinateur :
 
<ul>
 
<ul>
<li> Aymen Sellaouti, ''Méthode collaborative de segmentation et classification d'objets à partir d'images de télédétection à très haute résolution spatiale'', thèse en informatique de l'Université de Strasbourg en co-tutelle avec l'Université de Tunis, dirigée par Aline Deruyver et Khaled Bsaïes, soutenue le 16 septembre 2014
+
<li> Aymen Sellaouti, ''Méthode collaborative de segmentation et classification d'objets à partir d'images de télédétection à très haute résolution spatiale'', thèse en informatique de l'Université de Strasbourg en co-tutelle avec l'Université de Tunis, dirigée par Aline Deruyver et Khaled Bsaïes, soutenue le 16 septembre 2014.
<li> Jean-Noël Martin, ''No Free Lunch et recherche de solutions structurantes en coloration'', Thèse en informatique de l'Université Technologique de Belfort-Montbéliard, dirigée par Alexandre Caminada, soutenue le 9 décembre 2010
+
<li> Lhassane Idoumghar, ''Métaheuristiques Hybrides et Leurs Applications'', Thèse d'Habilitation à Diriger des Recherches en informatique, de l'Université de Haute Alsace, soutenue le 12 novembre 2012.
 +
<li> Jean-Noël Martin, ''No Free Lunch et recherche de solutions structurantes en coloration'', Thèse en informatique de l'Université Technologique de Belfort-Montbéliard, dirigée par Alexandre Caminada, soutenue le 9 décembre 2010.
 
<li> Olivier Pauplin, ''Adaptation de l'algorithme des mouches à un environnement dynamique réel'', Université Paris V, septembre 2007.
 
<li> Olivier Pauplin, ''Adaptation de l'algorithme des mouches à un environnement dynamique réel'', Université Paris V, septembre 2007.
 
<li> Kamel Slimani, ''Système d'échange et de partage de connaissances pour l'aide à la conception collaborative'', Université Lyon I, septembre 2006.
 
<li> Kamel Slimani, ''Système d'échange et de partage de connaissances pour l'aide à la conception collaborative'', Université Lyon I, septembre 2006.
Ligne 180 : Ligne 305 :
 
<li> Olivier Roux, ''Mémoire dans les algorithmes à colonie de fourmis'', Université du Littoral, décembre 2001.
 
<li> Olivier Roux, ''Mémoire dans les algorithmes à colonie de fourmis'', Université du Littoral, décembre 2001.
 
</ul>
 
</ul>
</ul>
 
 
===Diffusion scientifique===
 
<ul>
 
<li>Conférences invitées
 
<ul>
 
<li> ''Les Systèmes Complexes : une nouvelle science intégrative et prédictive pour une Santé 4P'', conférence de clôture du [http://www.asc.sn/congresDakar2013/ 7è Congrès Francophone Mondial de Chirurgie] à Dakar, Sénégal, 6/12/13
 
<li> [[media:AfficheTaiwan0513.pdf|''Personalised Open Education for the Masses'']], 2013 International Conference Future Earth Science Learning Embedded with Emerging Technologies International Conference, Taiwan Normal University, 17/05/13
 
<li> ''Towards Inventive Computers thanks to Artificial Evolution'', Triz Future 2012, Portugal.
 
<li> Terrasses du Numérique
 
<li> 2/06/2009: Keynote de la conférence [http://kaeiog.elka.pw.edu.pl/index.php?page=index Algorytmy Ewolucyjne i Optymalizacja Globalna'09] à Zawoja, Pologne : ''Artificial Evolution algorithms can use GPGPUs''
 
</ul>
 
<li>Tutoriels
 
<ul>
 
<li> PPSN 2011
 
<li>[http://www.sigevo.org/gecco-2010/tutorials.html#ecgpu Computation on GPUs] with W. Banzhaf and S. Harding, Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO 2010
 
<li> GECCO 2009
 
</ul>
 
<li>Séminaires
 
<ul>
 
<li>[https://my.vub.ac.be/nieuws/ecco-seminar-personalised-open-education-masses-poem ECCO Seminar: Personalised Open Education for the Masses (POEM), Vrije Universiteit Brussel] 11/04/2014
 
<li> [https://who.rocq.inria.fr/Gilles.Dowek/MoocLab/13janvier/collet.pptx ''POEM : Personalised Open Education for the Masses''], Séminaire Mooc-lab INRIA [https://who.rocq.inria.fr/Gilles.Dowek/MoocLab/13janvier/ Moocs : de la correction automatique à la personnalisation des cursus], Inria, Paris, 13 janvier 2014
 
<li> Institut des Systèmes Complexes
 
</ul>
 
</ul>
 
====Prix et distinctions====
 
<ul>
 
<li> Best Paper Award de la conférence EvoPAR'14 pour le papier :  [http://icube-publis.unistra.fr/papr/2014/4-LGCB14  E. Lutton, H. Gilbert, W. Cancino, B. Bach, P. Parrend, P. Collet, ''Visualisation of Island-Based Parallel Genetic Algorithms'', EVOPar, Granada, Espagne, Springer, LNCS, avril 2014]
 
<li> Prix de la compétition [http://www.gpgpgpu.com/gecco2012/ GPUs for Genetic and Evolutionary Computation] de la conférence mondiale GECCO’12 pour le papier P. Collet, F. Krüger, O. Maitre, ''GECCO 2012 GPGPU competition: The EASEA parallelization platform'', Gecco 2012, Philadelphia
 
</ul>
 
 
====Vulgarisation====
 
<ul>
 
<li> [[Dépêche AEF No 190761 du 6/12/13]] (Agence Éducation Formation), rédigée par Pascaline Marion
 
<li> DNA
 
<li> savoirs
 
</ul>
 
 
====Diffusion logicielle====
 
 
===Responsabilités scientifiques===
 
<ul>
 
<li> Domaine :
 
<ul>
 
<li> Optimisation de probl&egrave;mes complexes par
 
algorithmes stochastiques inspir&eacute;s de la nature.
 
<li> Parallélisation des algorithmes évolutionnaires sur clusters parallèles et cartes massivement parallèles de type GPGPU (General Purpose Graphic Processing Units).
 
</ul>
 
<li> Applications : fouille de donn&eacute;es en bio-informatique,
 
optimisation du param&eacute;trage d'implants cochl&eacute;aires,
 
optimisation de parcours p&eacute;dagogiques, recherche en automates
 
cellulaires, ...
 
<li>Sp&eacute;cialiste en :
 
  <ul>
 
    <li>Systèmes Complexes
 
    <li>Programmation G&eacute;n&eacute;tique,
 
    <li>Algorithmes &eacute;volutionnaires (algorithmes
 
        g&eacute;n&eacute;tiques, strat&eacute;gies d'&eacute;volution, et
 
        autres paradigmes connexes),
 
    <li>Algorithmes &eacute;volutionnaires interactifs,
 
    <li>Optimisation par essaim particulaire et par colonies de fourmis (OCF).
 
    <li>&Eacute;mergence (parall&eacute;lisme au niveau des donn&eacute;es,
 
    agents autonomes, ...).
 
    <li>Systèmes éducatifs intelligents.
 
    <li>Chirurgie Assistée par Ordinateur.
 
    <li>Avionique et mécanique du vol.
 
  </ul>
 
<li>Membre de l'<i>Advisory Board</i>, et auteur de trois chapitres du
 
livre [http://www.rennard.org/nicem/index.html Handbook of Research on Nature Inspired Computing for Economics and Management], (avec comit&eacute;
 
de lecture international), coordonné par [http://www.rennard.org/ J.-P. Rennard], Sept. 2006.
 
<li> Editeur en chef, avec [mailto:evelyne.lutton@inria.fr Evelyne Lutton], d'un numéro double sur l'[http://www.lavoisier.fr/notice/fr2746216280.html Evolution Artificielle] du journal TSI (Lavoisier), Janvier 2007.
 
<li> Auteur du langage [http://sourceforge.net/projects/easea EASEA] (<i>EAsy Specification of Evolutionary Algorithms</i>)
 
<!-- <li> Parrain du site [http://in.silico.free.fr in.silico], et mod&eacute;rateur du forum sur l'[http://in.silico.free.fr/nouveaux_forums/viewforum.php?f=9&sid=9ecdb327d1c13fa68135e128131171e8 &eacute;volution artificielle].
 
<li> S&eacute;rie d'entretiens sur le site
 
[http://in.silico.free.fr in.silico] (entretiens [http://in.silico.free.fr/index.php?mod=articles&ac=commentaires&id=3 1], [http://in.silico.free.fr/index.php?mod=articles&ac=commentaires&id=4 2], &agrave; suivre ...).-->
 
<li>Entretien dans le magazine [http://www.automatesintelligents.com/interviews/2001/avr/p_collet.html Automates Intelligents] d'avril 2001.
 
 
</ul>
 
</ul>
  
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==Enseignement==
+
==Organisation de manifestations / conf&eacute;rences==
* Cours
+
* Chairman de Complex Computational Ecosystems CCE'23 à Baku, Azerbaidjan
** [[Articles Introduction à la Recherche | Introduction à la Recherche L3]],
+
* Co-organisation de la conférence internationale [https://ea2017.inria.fr/ EA'2017] à Paris.
** [[Support de cours CPI | Culture et Pratique de l'Informatique L1]],
+
* Co-organisation du satellite [http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/TIMES/?CCS%2716_Satellite_%2338_%E2%80%94_TIMES&normal Territorial Intelligence for Multi-level Equity and Sustainability] de la [http://www.ccs2016.org/ Conference on Complex Systems 2016] à Amsterdam.
** Intelligence Artificielle L3,
+
* [http://cs-dc.org/CS-DC-15 CS-DC'15] : Président du Comité d'Organisation de la première e-conférence mondiale sur les Systèmes Complexes, sept-oct 2015, Phoenix, Arizona.
** Evolution Artificielle,
+
* [http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/conferences/BioinformaticsEurope2015London.pdf Bioinformatics Europe 2015 London] : Animateur de la table ronde ''Large scale computing tasks using cloud and mobile resources''.
** Syst&egrave;mes d'exploitation et architecture des ordinateurs,
+
* Co-chair avec [http://cptra.ln.edu.hk/staffProfile/mlwong.htm Man Leung Wong] du track ''Parallel Evolutionary Systems'' de la conférence GECCO'11 à Dublin.
** Algorithmique,
+
* Guest Editor avec [http://cptra.ln.edu.hk/staffProfile/mlwong.htm Man Leung Wong] d'un numéro spécial du journal international Springer ''Genetic Programming and Evolvable Machines'' intitulé ''Evolutionary Algorithms for Data Mining'', à paraître (cf. [http://gpemjournal.blogspot.com/2010/07/cfp-special-issue-on-evolutionary.html cfp]).
** langages C, C++, Java.
+
* Chairman de la session ''Evolutionary Multiobjective Optimization'' de la conférence [http://www.sigevo.org/gecco-2010/ GECCO'10] à Portland.
** [[media:PratiqueDesSystemes.pdf|Pratique des Systèmes d'Exploitation]]
+
* Animation du tutoriel ''Evolutionary Computation on GPUs'' avec [http://web.cs.mun.ca/~banzhaf/ Wolfgang Banzhaf] et [http://www.evolutioninmaterio.com/ Simon Harding] de la conférence [http://www.sigevo.org/gecco-2010/ GECCO'10] à Portland.
** [[media:FondementDesSystemes.pdf|Fondements des Systèmes d'Exploitation]]
+
* [https://lsiit.u-strasbg.fr/ea09/index.php/Main_Page EA'09] : Président de la 9ème Conférence Internationale sur l'Evolution Artificielle, oct 2009, Strasbourg.
** [[media:Alinea.pdf|Algèbre Linéaire Appliquée]]
+
* Conférencier invité de la conférence [http://kaeiog.elka.pw.edu.pl/index.php?page=index Algorytmy Ewolucyjne i Optymalizacja Globalna]'09 à Zawoja, Pologne.
** [[PC_-_Anglais_Scientifique|Anglais scientifique]]
+
* Co-organisateur de la 8&egrave;me Conf&eacute;rence Internationale sur l'Evolution Artificielle ([http://ea07.hant.li.univ-tours.fr EA'07]) &agrave; Tours, octobre 2007.
* Documents généraux
+
* Organisateur de la deuxi&egrave;me &eacute;cole d'&eacute;t&eacute; sur l'Evolution Artificielle</a> &agrave; Yravals en mai 2007.
** [[media:tdVim.pdf|Commencer avec vi]].
+
* <i>Chairman</i>, avec [mailto:vmasero@unex.es Valentin Masero] du track <i>Computer Applications in Health Care</i> ([http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/cahc07/SAC_CAHC_07.html CAHC'07]) du  22&egrave;me; <i>Symposium on Applied Computing</i> de l'[http://www.acm.org ACM] ([http://www.acm.org/conferences/sac/sac2007/ SAC'07]) &agrave; S&eacute;oul (Cor&eacute;e du sud), mars 2007.
** [[media:initLaTeX.pdf|Commencer avec LaTeX]] [http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/stages/initLaTeX.tgz (tarball à détarer dans un répertoire)].
+
* Organisateur de la  [http://www-lil.univ-littoral.fr/~fonlupt/yravals/index.html première école d'été sur l'Evolution Artificielle] &agrave; Yravals en juin 2006.
* Responsable du [http://dess-icc.univ-littoral.fr MASTER CCI](Comp&eacute;tence Compl&eacute;mentaire en Informatique) de l'ULCO de 2003 &agrave; 2006.
+
* <i>Programme Chair</i>, avec [http://www-iis.unil.ch/membres/mtomassi.html Marco Tomassini] de la 9&egrave;me conf&eacute;rence internationale sur la programmation g&eacute;n&eacute;tique  [http://www.evonet.info/eurogp2006/ EURO-GP'06] &agrave;    Budapest (Hongrie).
 +
* <i>Chairman</i>, avec    [mailto:vmasero@unex.es Valentin Masero] du track <i>Computer Applications in Health Care</i> ([http://dpt-info.u-strasbg.fr/~collet/SAC06CAHC.html CAHC'06]) du    21&egrave; <i>Symposium on Applied Computing</i> de l'[http://www.acm.org ACM] ([http://www.acm.org/conferences/sac/sac2006/ SAC'06])  &agrave; Dijon (France).
 +
* Co-organisateur des Conf&eacute;rences Internationales        [http://www.lifl.fr/EA2005/ EA'05] (Lille) et [http://ea.inria.fr/ea03 EA'03] (Marseille).
 +
* <i>Publication Chair</i> de la 8&egrave; conf&eacute;rence  internationale sur la programmation g&eacute;n&eacute;tique  [http://www.evonet.info/eurogp2005/ EURO-GP'05] &agrave;    Lausanne (Suisse).
 +
*Pr&eacute;sident de la 5&egrave;me Conf&eacute;rence Internationale sur    l'Evolution Artificielle ([http://www.cmap/polytechnique.fr/~ea01/ EA'01]) au Creusot (France).
 +
* Co-organisateur des  [http://www-lil.univ-littoral.fr/~fonlupt/JET15 JETs] (Journ&eacute;es &Eacute;volutionnaires Trimestrielles) 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17.
  
==Responsabilités administratives==
+
== Et pour finir... ==
* Directeur du Département d'Informatique de l'UFR Mathématique et Informatique de l'Université de Strasbourg depuis juillet 2011
+
...une un peu trop longue [[biographie de Pierre Collet]]
* Membre du Comité d'Experts en informatique 27è section depuis 2010.
 
* Président du comité de sélection
 
==Liens généraux==
 
* [[Pourquoi la biodiversité est essentielle pour l'homme]] ?
 
* [[À quoi sert la recherche fondamentale]] ?
 
  
==Liens personnels==
+
[[Un peu de poésie]]
Page web de [http://maths.collet.free.fr/ Val&eacute;rie Collet].
 
  
 
==Contact==
 
==Contact==
Mon bureau est le C337 (au 3ème étage) du bâtiment C du LSIIT (situé très logiquement entre le bâtiment B et le bâtiment A).
+
Pr Pierre Collet
 +
Mon bureau est situé au 4 rue Kirschleger,
 +
Bâtiment 3 de la Faculté de Médecine
 +
étage (équipe CSTB).
  
<br>
+
  Pierre Collet
  Pr Pierre Collet
+
  ICUBE - UMR CNRS 7357
  LSIIT - UMR7005
+
  Tél : +33 (0)3.68.85.45.80 / Fax : +33 (0)3.68.85.44.55
Pôle API
+
  4 rue Kirschleger, 67000 Strasbourg
  Bd Sébastien Brant - BP 10413
 
  67412 Illkirch cedex
 
  
Tel : +33 (0)3 68.85.45.80
+
  courriel : Pierre.Collet @ unistra.fr
Fax : +33 (0)3 68.85.44.45
 
  courriel : Pierre.Collet @ unistra.Fr
 
  
Page modifiée le 31 décembre 2009 à 08:44 (CET)
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[[o]]

Version actuelle datée du 19 janvier 2024 à 04:24

Pierre Collet 2022.jpg
Professeur (enseignant-chercheur) en informatique détaché à compter du 1er février 2024 à l'Institut de Technologie pour l'Innovation en Santé et Bien-être (ITISB) de l'Université Andrés Bello à Viña del Mar, Valparaiso, Chili.
Ma nouvelle page web à compter du 1er février 2024 se trouve maintenant ici.




Jusqu'au 31 janvier 2024, Pierre Collet était :

Professeur (enseignant-chercheur) en informatique :


Etudes à l'étranger, propositions de stages

A quoi sert la science ?

Responsabilités actuelles

Administratives

  • Co-responsable (avec Olivier Poch) de l'équipe Systèmes Complexes et Bioinformatique Théorique créée au 1er janvier 2016.
  • Expert pour l'Université Franco-Azerbaidjanaise UFAZ (co-créée avec Jean-Marc Planeix, Philippe Turek et Eckart Hötzel en septembre 2016, sous l'égide d'Alain Beretz puis Michel Deneken)
  • Co-fondateur et co-coordinateur (avec le Pr Cyrille Bertelle, de l'Université du Havre et Paul Bourgine, Président) de l'UniTwin CS-DC de l'UNESCO, un réseau de 130 universités dans 38 pays dont l'objectif est de développer la nouvelle science des Systèmes Complexes par l'éducation et la recherche. Le CS-DC est donc très similaire à une grande université internationale. Il a été validé par Irina Bokova, Directrice Générale de l'UNESCO en juillet 2014. Le président du CS-DC est Paul Bourgine.
  • Directeur du Réseau National des Systèmes Complexes (RNSC), Groupement d'Intérêt Scientifique (GIS) depuis novembre 2017.
  • Correspondant Relations Internationales du Département d'Informatique de l'UFR Mathématique et Informatique depuis sept. 2016
  • Membre du bureau et du conseil de l'UniTwin Complex Systems Digital Campus de l'UNESCO depuis juillet 2014
  • Coordinateur de ECCE (e-laboratoire international sur les écosystèmes de calcul complexes) depuis juillet 2015.
  • Coordinateur du Campus Numérique des Systèmes Complexes de l'Université de Strasbourg depuis mai 2012.
  • Membre du comité des sages de l'Association Evolution Artificielle depuis 2008.
  • Membre du comité directeur des conférences EuroGP depuis 2005.
  • Membre du comité directeur des conférences internationales sur l'Evolution Artificielle (organisées par l'association Evolution Artificielle) depuis 2001.

Scientifiques

Enseignement

Recherche

Domaines de recherche

  • Intelligence Artificielle Éthique, Autonome et Explicable (XEA-AI).
  • Optimisation de problèmes complexes par algorithmes stochastiques inspirés de la nature.
  • Parallélisation des algorithmes évolutionnaires sur clusters parallèles et cartes massivement parallèles de type GPGPU (General Purpose Graphic Processing Units).
  • Applications : fouille de données en bio-informatique, optimisation du paramétrage d'implants cochléaires, optimisation de parcours pédagogiques, recherche en automates cellulaires, ...
  • Spécialiste en :
    • Systèmes Complexes,
    • Systèmes à base de règles, systèmes de classeurs,
    • Programmation Génétique,
    • Algorithmes évolutionnaires (algorithmes génétiques, stratégies d'évolution, et autres paradigmes connexes),
    • Algorithmes évolutionnaires interactifs,
    • Optimisation par essaim particulaire et par colonies de fourmis (OCF).
    • Émergence (parallélisme au niveau des données, agents autonomes, ...).
    • Systèmes éducatifs intelligents.
    • Chirurgie Assistée par Ordinateur.
    • Avionique et mécanique du vol.

    Projets majeurs (et plateformes)

    POEM (Personalised Open Education for the Masses)

    EASEA CLOUD Thèses et projets de recherche réalisés (à ma connaissance) avec (et sur) EASEA :

    • Alejandro Rinçon Lopez, "Portage de la plateforme EASEA sur le Cloud", projet ANR EASEA-CLOUD, juin 2014 - mars 2015
    • Carlos Catania, Optimisation d'une flotte de véhicules médicaux, Fev 2014 - Fev 2015, pour la société Synovo
    • Thomas Chabin, "Visualisation Scientifique d'algorithmes évolutionnaires distribués", projet ANR EASEA-CLOUD, mars 2014 - mars 2015
    • Renaud Vanhoutrève (oct 13 -) Alignement de séquences protéiques pour une analyse de données NGS appliquée à la Santé en co-direction avec Julie Thompson, LBGI
    • Igor Santos Peretta (oct 12 - Nov 15) Evolution of an integrated model for a complex system through massively parallel Genetic Programming, en co-direction avec Keiji Yamanaka, Uberlandia, Brasil.
    • Farzad Sehat, Gestion de portefeuilles financiers par évolution artificielle, M2 Recherche, mars - sept. 2011
    • Frédéric Krüger, Recherche de zéolithes par évolution artificielle, M2 Recherche, mars - sept 2011
    • Arijit Biswas, thèse de l'IIT Kharagpur sur l'optimisation du processus d'extraction de Manganèse de nodules polymétalliques extraits de fonds sous-marins, dirigée par le Professeur Nirupam Chakraborty,déc. 10.
    • Claire Bourgeois-République, Plateforme de réglage automatique et adaptatif d'implant cochléaire par algorithme évolutionnaire interactif, Université de Bourgogne, décembre 2004.
    • Philippe Guermeur, Vision robotique monoculaire : reconstruction du temps avant collision et de l'orientation des surfaces à partir de l'analyse de la déformation, Université de Rouen, octobre 2002.

    HEVEA (Étude et Valorisation de l'Écologie Auditive) Responsable Scientifique du projet RNTS (Projet Hospitalier de Recherche Clinique) HEVEA (130k€, Sept 05 - Sept 06) : expérimentation sur 10 patients d'un réglage d'implant cochléaire par algorithme évolutionnaire interactif. Bio-Inspired Classification and Data-Mining Algorithms for Bioinformatics Porteur du projet européen Interreg IIIa 182b Bio-Inspired Classification and Data-Mining Algorithms for BioInformatics avec l'Université du Kent à Canterbury (379 KEuros, Sept 06 - Août 07). Emergence of Computation in Cellular Automata Responsable français du projet anglais EPSRC Emergence of Computation in Cellular Automata, EP/D066174/1 avec Andrew Adamatsky, de l'UWE-Bristol (137 KEuros, Sept 06 - Oct 07). Magellan Responsable scientifique du projet Magellan (1,7 MF, Sept 93 - Sept. 98) de Création d'un prototype fonctionnel de Chirurgie Assistée par Ordinateur pour l'ORL. Projet financé par l'Institut Électricité Santé (EDF), la Fondation de l'Avenir, l'APHP.

    Anciens projets

    Publications

    • Liste des publications
    • Nombre d'Erdös de 3 grâce à la publication d'un livre avec Pierre Liardet, décédé en Août 2014. Pierre était un grand mathématicien, très ouvert, qui répondait toujours présent lorsqu'on le sollicitait.
    • Livres
    • Editeur en chef, avec Evelyne Lutton, d'un numéro double sur l'Evolution Artificielle du journal TSI (Lavoisier), Janvier 2007.
    • Auteur du langage EASEA (EAsy Specification of Evolutionary Algorithms)

    Prix et distinctions

    diffusion scientifique

    Keynotes

    • Biowin days
    • ICAMMP - IV
    • Évolution, évolution artificielle et diversité, Clôture du Colloque Biodiversité et Résilience, 12 - 14 octobre 2015, Institut des Systèmes Complexes Paris Île-de-France.
    • "Influence de la cyberscience sur la vie de l’homme et sa vision du monde", Colloque XXIè siècle, une nouvelle renaissance ?, 21/06/2014 (transcription)
    • Les Systèmes Complexes : une nouvelle science intégrative et prédictive pour une Santé 4P, conférence de clôture du 7è Congrès Francophone Mondial de Chirurgie à Dakar, Sénégal, 6/12/13
    • Personalised Open Education for the Masses, 2013 International Conference Future Earth Science Learning Embedded with Emerging Technologies International Conference, Taiwan Normal University, 17/05/13
    • Towards Inventive Computers thanks to Artificial Evolution, Triz Future 2012, Portugal.
    • 2/06/2009: Keynote de la conférence Algorytmy Ewolucyjne i Optymalizacja Globalna'09 à Zawoja, Pologne : Artificial Evolution algorithms can use GPGPUs

    Conférences invitées

    • Terrasses du Numérique
    • Diversité en biologie

    Séminaires

    Tutoriels

    • PPSN 2011
    • Computation on GPUs with W. Banzhaf and S. Harding, Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO 2010
    • GECCO 2009

    Ecoles d'été

    • Education numérique à l'X

    Articles dans la presse

    Diffusion logicielle

    • POEM
    • EASEA CLOUD
    • HOPE

    Encadrement doctoral et de recherche

    Direction / co-direction / encadrement / co-encadrement de thèses en cours

    • Léo Chéneau (démarrage en cours : thèse CIFRE IBM sur l'évolution de circuits quantiques pour en minimiser le bruit)
    • Tam'si Ley (01/11/2021, 50% avec Johannes Schachenmayer) "Resource estimation for practical quantum computing"
    • Lalla-Aïcha Koné (01/11/2020, 75% avec Ahmedou Haouba) "Aide à la décision à partir de motifs extraits de données massives pour l’amélioration du service public"
    • Yohan Solon (15/11/2020, 75% avec Ecaterina Pacurar) "Efficacité de l'inter-tutorat en contexte d'une pédagogie de masse personnalisée"

    Thèses soutenues (en tant que directeur / co-directeur / garant / encadrant / co-encadrant)

    • Hiba Khodji (01/11/2020 avec Julie Thompson, encadrement Anne Jeannin-Girardon) "Caractérisation de la transférabilité des représentations latentes des réseaux neuronaux profonds pour la détection d’erreurs dans la prédiction de séquences de gènes" soutenue à l'Université de Strasbourg le 7 novembre 2023
    • Corentin Meyer (01/10/2020, 50% avec Olivier Poch) « MYO-xIA : IA explicable pour la classification intégrée et la prédiction des myopathies congénitales » Projet Artic, soutenue à l'Université de Strasbourg le 20 octobre 2023
    • Romain Orhand (Oct 2018 - Nov 2022), 50% avec Pierre Parrend) "Développement d'ordinateurs autonomes combinant évolution artificielle et intelligence artificielle", soutenue à Strasbourg le 10 novembre 2022
    • Anne Jeannin-Girardon (thèse d'HDR) "Vers une Intelligence Artificielle Autonome, Explicable et Éthique : alliance entre approches ontologiques et législatives", soutenenue à Strasbourg le 9 novembre 2022
    • Anna Ouskova (Août 2018 - Mai 2022, 50% avec Pierre Parrend) "Optimisation évolutionnaire de systèmes de réfrigération magnétique utilisant des alliages magnétocaloriques" soutenue à Strasbourg le 24/05/2022.
    • Nicolas Scalzitti (Oct 19 - Sept 21) "Nouvelle stratégie d'annotation des génomes par l'utilisation d'algorithmes d'intelligence artificielle" (co-dirigée à 50% avec Julie Thompson), thèse de l'Université de Strasbourg en partie financée par fondation Bioniria, soutenue le 29 septembre 2021 à l'Université de Strasbourg.
    • Ulviya Abdulkarimova (Oct 18 - Sept 21) "Sinus-it: an Evolutionary Approach to Harmonic Analysis", (50% avec Christian Rolando), thèse de l'Université de Strasbourg en collaboration avec l'Université de Lille et l'Université Franco-Aserbaïdjanaise (UFAZ) soutenue le 2 septembre 2021 en visioconférence.
    • Salma Mesmoudi (HDR, Dec 2020) "Résolution de problèmes et intégration de données multi-échelle et multi-source : approche géométrique et dynamiques complexes"
    • Fabio Guigou (Dec 14 - Juin 19) "The Artificial Immune Ecosystem: a scalable immune-inspired active classifier", co-encadrant : Pierre Parrend, thèse de l'Université de Strasbourg soutenue le 18 juin 2019 à l'Université de Strasbourg
    • Pierre Parrend (HDR, décembre 2017) Emergent Industrial Ecosystems, Habilitation à Diriger des Recherches de l'Université de Strasbourg soutenue le 12 décembre 2017 à l'ECAM, Strasbourg
    • Pierre Masai (Oct 14 - Sept 17) "Modeling the lean organization as a complex system", thèse de l'Université de Strasbourg soutenue le 29 septembre 2017 à l'Université de Strasbourg
    • Igor Santos Peretta (oct 12 - sept 15) Evolution of an integrated model for a complex system through massively parallel Genetic Programming, en co-direction avec Keiji Yamanaka, thèse de l'Université de Strasbourg en co-tutelle avec l'université d'Uberlandia soutenue le 19 septembre 2015 à l'Université d'Uberlandia, Brésil.
    • Cécilia Zanni-Merk (HDR 11/13 - 11/14 thèse d'Habilitation à Diriger les Recherches) "Knowledge Technologies for Problem Solving in Engineering", garant : Pierre Collet, soutenue le 20 novembre 2014 à l'Université de Strasbourg
    • Stéphane Querry (09/10 - 09/14) Control and modelling of autonomous aircrafts by evolutionary computing, thèse confidentielle Polyvionics, sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 29 septembre 2014 à l'Université de Strasbourg
    • Wei Yan, (09/10 - 02/14)Modélisation de (Méta)Connaissances pour la Conception Inventive, en co-direction avec Denis Cavallucci, LGeCo, co-encadrée par Cécilia Zanni-Merk. soutenue le 7 février 2014 à l'INSA de Strasbourg
    • Frédéric Krüger (10/11 - 02/14), Determination of end user power load profiles by parallel evolutionary computing, sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 17 février 2014 à Électricité de Strasbourg
    • Nicolas Lachiche (12/10 - 12/11 thèse d'Habilitation à Diriger des Recherches), Relational data mining guided by needs, Garant : Pierre Collet, soutenue le 5 décembre 2011 à l'Université de Strasbourg
    • Ogier Maitre (10/08 - 09/11), GPGPU for Evolutionary Algorithms, sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 30 septembre 2011 à l'Université de Strasbourg
    • Olivier Kühn (10/07 - 10/10), Methodology for Knowledge-Based Engineering Template Update - Focus on Decision Support and Instances Update, en co-direction avec Parisa Ghodous, thèse financée par la Société Prostep, soutenue le 22 octobre 2010 à l'Université de Strasbourg
    • Grégory Valigiani, Développement d'un paradigme d'optimisation par Hommilière et application à l'enseignement par internet, Université du Littoral Côte d'Opale, thèse financée par la société Paraschool, sous la direction de Pierre Collet, soutenue en novembre 2006.
    • Claire Bourgeois-République, Plateforme de réglage automatique et adaptatif d'implant cochléaire par algorithme évolutionnaire interactif, Université de Bourgogne encadrée par Pierre Collet décembre 2004.
    • Yann Landrin-Schweitzer, Algorithmes génétiques interactifs pour le text-retrieval, thèse de l'Université d'Orsay dirigée par Evelyne Lutton, co-encadrée par Pierre Collet, soutenue en septembre 2003.

    Contrats post-doctoraux

    • Alejandro Rinçon Lopez, "Portage de la plateforme EASEA sur le Cloud", projet ANR EASEA-CLOUD, juin 2014 - mars 2015
    • Carlos Catania, Optimisation d'une flotte de véhicules médicaux, Fev 2014 - Fev 2015, pour la société Synovo
    • Waldo Cancino, Portage de la plate-forme EASEA-CLOUD sur la grille, Oct. 2012 - Oct 2013, projet ANR EASEA-CLOUD
    • Lidia Yamamoto, Artificial Chemistries on GPGPU, Avril 2010 - Avril 2011, financement Région Alsace
    • Deepak Sharma, Projet Administrateur Réseau Artificiel (ARA), société Kelerio, Mai 2009 - Mai 2010
    • Pierrick Legrand, "Projet RNTS HÉVÉA : Étude et Valorisation de l'Écologie Auditive", Sept 2005 - Sept 2006

    Encadrement de stages de recherche

    • Quentin Christoffel, "Détection de l'incertitude d'un modèle d'intelligence artificielle", février 2021 - juillet 2021
    • Thomas Chabin, "Visualisation Scientifique d'algorithmes évolutionnaires distribués", projet ANR EASEA-CLOUD, mars 2014 - mars 2015
    • Frédéric Krüger, Recherche de zéolithes par évolution artificielle, M2 Recherche, mars - sept 2011
    • Farzad Sehat, Gestion de portefeuilles financiers par évolution artificielle, M2 Recherche, mars - sept. 2011
    • Arijit Biswas, thèse de l'IIT Kharagpur sur l'optimisation du processus d'extraction de Manganèse de nodules polymétalliques extraits de fonds sous-marins, dirigée par le Professeur Nirupam Chakraborty, avr. 09 - déc. 09
    • Ariel Tchougang, Etude du Context-Aware Crossover en Programmation Génétique, M2 Recherche, mars 08 - sept 08

    Jurys de thèse

    • En tant que Président :
      • Xin NI, Inventive Solutions Retrieval from Patent Documents via Natural Language Processing, thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Denis Cavallucci, co-encadrée par Ahmed Samet, soutenue le 18 décembre 2021.
      • Yann hodé, Contribution à l'interprétation d'images et vérification de la consistance d'un graph, thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Aline Deruyver, soutenue le 12 novembre 2018.
      • Karim el Soufi, Study of circular code motifs in nucleic acid sequences, thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Christian Michel, soutenue le 24 janvier 2017
      • Amir Jaberzadeh, "Simulation of heat transfer and automatic optimization of multiple probes trajectories for pre-operative planning of percutaneous thermoablation interventions", thèse en Informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Caroline Essert, soutenue le 13 février 2015.
      • Idriss Aberkane, Ballade de la Conscience entre Orient et Occident : une perspective soufie sur la conscience occidentale, connectant The Kasidah de R. F. Burton et The Waste Land de T. S. Eliot, Thèse en Études Méditerranéennes et Littérature Comparée de l'Université de Strasbourg, dirigée par Eric Geoffroy et Patrick Laude, soutenue le 16 juin 2014.
      • Jonathan Fréchard, Systèmes d'entraînement de bandes flexibles : optimisation multicritère des performances dynamiques par approche évolutionnaire, Thèse en automatique de l'Université de Strasbourg (INSA) dirigée par Dominique Knittel, soutenue le 2 juillet 2013.
      • Alexis Bultey, Représentation hybride des heuristiques et méta-heuristiques utilisées pour la conception innovante, INSA de Strasbourg, juin 2009.
      • Camélia Ignat, Improving Statistical Alignment and Translation Using Highly Multilingual Corpora, INSA de Strabourg, juin 2009.
      • Arnaud Quirin, "Images de télédétection Images hyperspectrales Intelligence artificielle Règles de classification Systèmes de classifieurs", thèse de l'Université Louis Pasteur dirigée par Jerzy Korczak et Massimo Menenti, soutenue en décembre 2005.
    • En tant que rapporteur :
      • Marwa BEN M’BAREK, Détection de communautés dans les grands réseaux : Application aux réseaux d'interactions de gènes, Thèse en informatique de l'Université PSL Paris Dauphine, en cotutelle avec l'Université de Tunis El Manar, soutenue à Paris le 14 octobre 2022.
      • Ahmed Hadj Said, Intégration du stockage dans les méthodes de planification des réseaux électriques basse tension, Thèse en informatique de l'Université Grenoble-Alpes, soutenue le 31 janvier 2018.
      • Idriss Aberkane, "Mind Ergonomy for the Knowledge Economy", Thèse en Gestion de l'Université Paris Saclay Ecole Polytechnique, dirigée par Pierre-Jean Benghozi et Paul Bourgine, soutenue le 3 février 2016.
      • Meysam Hashemi, "Modélisation mathématique et simulation numérique de populations neuronales thalamo-corticales dans le contexte de l'anesthésie générale", Thèse en informatique de l'Université de Lorraine, dirigée par Axel Hutt, soutenue le 14 janvier 2016.
      • Abdelhamid Zouhair, "Raisonnement à Partir de Cas Dynamique Multi-agent - Application à un Système de Tuteur Intelligent", Thèse en informatique en cotutelle de l'Université du Havre (co-direction Cyrille Bertelle) et de l'Université Abelmalek Essaâdi (Maroc, co-direction Benaissa Amami), soutenue le 20 octobre 2014.
      • Messaouda Mechelfekh, "L’islam spirituel contemporain au travers d’Internet : interactions, modélisation et prospective", Thèse de doctorat en Langues et littératures étrangères de l'Université de Strasbourg, dirigée par Eric Geoffroy soutenue le 11 septembre 2014.
      • Gilian Basso, Approche à base d’agents pour l’ingeniérie et le contrôle de micro-réseaux, Thèse en Informatique de l'Université de Technologie Belfort-Montbéliard, dirigée par Vincent Hilaire, soutenue le 9 décembre 2013.
      • Mathieu Chouchane, Optimisation spatio-temporelle d’efforts de recherche pour cibles manoeuvrantes et intelligentes, Thèse en Informatique de l'Université d'Aix-Marseille, dirigée par Mustapha Ouladsine et encadrée par Sébastien Paris et François le Gland, soutenue le 17 octobre 2013.
      • Manuel Clergue, Paysages et Dynamiques : contributions à l'évolution artificielle, Thèse d'Habilitation à Diriger des Recherches de l'Université des Antilles et de la Guyane, soutenue le 7 décembre 2011.
      • Sébastien Derivaux, Construction et classification d'objets à partir d'images de télédétection par une approche itérative guidée par des connaissances du domaine, Université de Strasbourg, avril 2009. Rapporteur : Renaud Barate, « Apprentissage de fonctions visuelles pour un robot mobile par programmation génétique, » Ecole Nationale Supérieur de Techniques Avancées, novembre 2009.
      • Laura Diosan, Exploring Hybrid Approaches based on Evolutionary Algorithms, INSA de Rouen, octobre 2008.
      • Amir Nakib, Conception de méta-heuristiques d'optimisation pour la segmentation automatique d'images. Application à des images biomédicales, Université Paris 12, décembre 2007.
      • Dalibor Fiala, 'Web Mining Methods for the Detection of Authoritative Sources, Université Louis Pasteur, Strasbourg, novembre 2007.
      • Salma Mesmoudi, Conception d'un système informatique mimétique pour résoudre le problème du voyageur de commerce : Application à la cartographie physique du génome, Université de Tanger, Novembre 2005.
    • En tant qu'examinateur :
      • Aymen Sellaouti, Méthode collaborative de segmentation et classification d'objets à partir d'images de télédétection à très haute résolution spatiale, thèse en informatique de l'Université de Strasbourg en co-tutelle avec l'Université de Tunis, dirigée par Aline Deruyver et Khaled Bsaïes, soutenue le 16 septembre 2014.
      • Lhassane Idoumghar, Métaheuristiques Hybrides et Leurs Applications, Thèse d'Habilitation à Diriger des Recherches en informatique, de l'Université de Haute Alsace, soutenue le 12 novembre 2012.
      • Jean-Noël Martin, No Free Lunch et recherche de solutions structurantes en coloration, Thèse en informatique de l'Université Technologique de Belfort-Montbéliard, dirigée par Alexandre Caminada, soutenue le 9 décembre 2010.
      • Olivier Pauplin, Adaptation de l'algorithme des mouches à un environnement dynamique réel, Université Paris V, septembre 2007.
      • Kamel Slimani, Système d'échange et de partage de connaissances pour l'aide à la conception collaborative, Université Lyon I, septembre 2006.
      • Amine Boumaza, Application de l'Algorithme des Mouches à la trajectoire de robots virtuels, Université d'Orsay, Mai 2004.
      • Emmanuel Sapin, Recherche par algorithmes évolutionnaires d'automates cellulaires universels, Univ. de Bourgogne, décembre 2003.
      • Philippe Guermeur, Vision robotique monoculaire : reconstruction du temps avant collision et de l'orientation des surfaces à partir de l'analyse de la déformation, Université de Rouen, octobre 2002.
      • Bogdan Stanciulescu, Identification de modèles physiques d'animation par évolution artificielle, Université Joseph Fourier de Grenoble, mai 2002.
      • Olivier Roux, Mémoire dans les algorithmes à colonie de fourmis, Université du Littoral, décembre 2001.

    Anciens Projets

    Cliquez ICI pour quelques anciens projets.

    Organisation de manifestations / conférences

    • Chairman de Complex Computational Ecosystems CCE'23 à Baku, Azerbaidjan
    • Co-organisation de la conférence internationale EA'2017 à Paris.
    • Co-organisation du satellite Territorial Intelligence for Multi-level Equity and Sustainability de la Conference on Complex Systems 2016 à Amsterdam.
    • CS-DC'15 : Président du Comité d'Organisation de la première e-conférence mondiale sur les Systèmes Complexes, sept-oct 2015, Phoenix, Arizona.
    • Bioinformatics Europe 2015 London : Animateur de la table ronde Large scale computing tasks using cloud and mobile resources.
    • Co-chair avec Man Leung Wong du track Parallel Evolutionary Systems de la conférence GECCO'11 à Dublin.
    • Guest Editor avec Man Leung Wong d'un numéro spécial du journal international Springer Genetic Programming and Evolvable Machines intitulé Evolutionary Algorithms for Data Mining, à paraître (cf. cfp).
    • Chairman de la session Evolutionary Multiobjective Optimization de la conférence GECCO'10 à Portland.
    • Animation du tutoriel Evolutionary Computation on GPUs avec Wolfgang Banzhaf et Simon Harding de la conférence GECCO'10 à Portland.
    • EA'09 : Président de la 9ème Conférence Internationale sur l'Evolution Artificielle, oct 2009, Strasbourg.
    • Conférencier invité de la conférence Algorytmy Ewolucyjne i Optymalizacja Globalna'09 à Zawoja, Pologne.
    • Co-organisateur de la 8ème Conférence Internationale sur l'Evolution Artificielle (EA'07) à Tours, octobre 2007.
    • Organisateur de la deuxième école d'été sur l'Evolution Artificielle</a> à Yravals en mai 2007.
    • Chairman, avec Valentin Masero du track Computer Applications in Health Care (CAHC'07) du 22ème; Symposium on Applied Computing de l'ACM (SAC'07) à Séoul (Corée du sud), mars 2007.
    • Organisateur de la première école d'été sur l'Evolution Artificielle à Yravals en juin 2006.
    • Programme Chair, avec Marco Tomassini de la 9ème conférence internationale sur la programmation génétique EURO-GP'06 à Budapest (Hongrie).
    • Chairman, avec Valentin Masero du track Computer Applications in Health Care (CAHC'06) du 21è Symposium on Applied Computing de l'ACM (SAC'06) à Dijon (France).
    • Co-organisateur des Conférences Internationales EA'05 (Lille) et EA'03 (Marseille).
    • Publication Chair de la 8è conférence internationale sur la programmation génétique EURO-GP'05 à Lausanne (Suisse).
    • Président de la 5ème Conférence Internationale sur l'Evolution Artificielle (EA'01) au Creusot (France).
    • Co-organisateur des JETs (Journées Évolutionnaires Trimestrielles) 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17.

    Et pour finir...

    ...une un peu trop longue biographie de Pierre Collet

    Un peu de poésie

    Contact

    Pr Pierre Collet
    Mon bureau est situé au 4 rue Kirschleger,
    Bâtiment 3 de la Faculté de Médecine
    5è étage (équipe CSTB).
    
    Pierre Collet
    ICUBE - UMR CNRS 7357
    Tél : +33 (0)3.68.85.45.80 / Fax : +33 (0)3.68.85.44.55
    4 rue Kirschleger, 67000 Strasbourg
    
    courriel : Pierre.Collet @ unistra.fr
    

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