Différences entre les versions de « Parallélisation sur GPU de calcul pour la chimie »
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Programmation sur GPU (CUDA/OPENCL) du calcul de l’énergie d'interaction d'un système moléculaire (modélisation moléculaire) | Programmation sur GPU (CUDA/OPENCL) du calcul de l’énergie d'interaction d'un système moléculaire (modélisation moléculaire) | ||
Version actuelle datée du 24 mai 2016 à 16:02
* Encadrants : Pr Pierre Collet, Pr Marc Heny * Lieu du l'apprentissage : Laboratoire ICUBE, équipe CSTB, 3 rue Humann, 67000 Strasbourg * Stage d'été 2016 de 2 à 3 mois
Programmation sur GPU (CUDA/OPENCL) du calcul de l’énergie d'interaction d'un système moléculaire (modélisation moléculaire)
Nous utilisons de manière routinière un programme (MDA) de calcul de l'énergie d'interaction par groupes (interactions entre ensembles d'atomes choisis). Ce programme utilise la sommation d'Ewald pour le calcul des interactions électrostatiques de systèmes périodiques. Cette méthode décompose le calcul en deux parties : un calcul dans l'espace direct limité par un rayon maximal d'interaction (cutoff) et un calcul dans l'espace réciproque (transformée de Fourier).
Le but de ce stage sera d'essayer de paralléliser sur GPU (Nvidia GTX780) ces deux calculs (déjà parallélisés en mémoire partagée avec openmp) de manière efficiente.