Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

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De Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle
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Version du 17 avril 2023 à 10:09

Activités de l'équipe en 2023 | Années précédentes

Activités scientifiques

Avril

6/04 : Article accepté dans Frontiers in Bioinformatics : Real or fake? Measuring the impact of protein annotation errors on estimates of domain gain and loss events, A. Kress et al. 2023

19/04 : Séminaire invité, P. Parrend : Trusted Graph for explainable detection of cyberattacks, au Cyber CNI Lecture Series (TALK.cybercni.fr) qui vise à sensibiliser tous les publics aux questions de cybersécurité et à permettre un dialogue permanent entre les experts de l'industrie et du monde universitaire et le grand public.

Mars

6/03 : Dépôt d'un sujet de thèse en codirection entre Laurence Choulier (Laboratoire de Bioimagerie et Pathologies, UMR7021) et Odile Lecompte
6/03 : Dépôt d'un sujet de thèse en codirection entre Jean Louis Mandel (IGBMC) et Julie Thompson
13/03 : Présentation à la première rencontre du groupe de travail "Aspects Computationnels de l'Éthique" (GDR RADIA) au LIP6, Paris : "Éléments d'épistémologie et d'éthique des systèmes d’apprentissage automatique", Anne Jeannin-Girardon
14/03 : Dépôt du projet SMART4CBT (Sciences sociales, Microenvironnement & analyses multiomiques dans la résistance au RadioThérapie dans les tumeurs cérébrales de l'enfant) pour la création d'un Centre de Recherche Intégrée Nord-Est en Oncopédiatrie (appel à projet national INCA), Olivier Poch
15/03 : Rencontre avec les membres de la SATT CONECTUS pour la valorisation des outils du CSTB et de BiGEst-ICube, Olivier Poch, Arnaud Kress/Luc Mouliner
26/03 : Dépôt de la maquette du nouveau parcours Bioinformatique et bioimagerie structurale du Master Sciences du vivant de Strasbourg (co-responsable : O. Lecompte)
27-31/03 : Participation de J.-S. Sereni au colloque en ligne « χ-boundedness », dans le cadre du réseau A Sparse (Graphs) Coalition
29/03 : Article publié dans le Journal of Fungi : C. Mayer et al. CeGAL: Redefining a Widespread Fungal-Specific Transcription Factor Family Using an In Silico Error-Tracking Approach

Février

02/02 : Réunion de travail avec Emmanuelle Leize (Laboratoire de Spectrométrie de Masse des Interactions et des Systèmes) pour discuter d'une collaboration autour de l'utilisation d'approches IA en protéomique. J. Thompson, K. Chennen.
02-03/02 : Participation de Dorine Merlat à la conférence Omics Days 2023 (Montpellier)
8/02 : Participation au cercle de mentorat (O. Lecompte)

Janvier

09/01 : Séminaire invité de D. Merlat - ERGA Annotation Committee
11/01: intervention à la conférence Intelligence Artificielle de l'ESBS : "Intelligence artificielle, éthique et santé" (A. Jeannin-Girardon)
12/01: Participation aux Journées des Universités (O. Lecompte)
23-25/01 : Présentation d'un poster aux rencontres ALPHY (Grenoble) par Dorine Merlat

Visiteurs

04-08/04 : Visite de J. Volec (Czech Technical University, République tchèque).

Doctorats


Stages

15/03 : Début du stage M1 de Burak Arti, M1 BSIB. Encadrement: Julie Thompson et Laetitia Poidevin
15/03 : Début du stage M1 de Julien Schaffer, M1 BSIB. Encadrement: Julie Thompson et Kirsley Chennen
15/03 : Début du stage M1 de Dehelia Chettouf, M1 BSIB. Encadrement: Claudine Mayer, Kirsley Chennen et Olivier Poch
15/03 : Début du stage M1 de Migena Bejko, M1 BSIB. Encadrement: Kirsley Chennen, Claudine Mayer et Olivier Poch
15/03 : Début du stage M1 de Deborah Antonio, M1 BSIB. Encadrement: Claudine Mayer et Olivier Poch

27/02 : Début du stage M2 de Fazil Mammadov, UFAZ, Baku. Encadrement: Rabih Amhaz

15/01 : Début du stage M2 de Lucille Herbay (Science de la vie, biologie moléculaire) encadrée par Julie Thompson, Arnaud Kress

Activités administratives

9/02 : Réunion du groupe de travail RDA Unistra (J. Thompson, Paulette Lieby)
10/02 : Comité de pilotage Science Ouverte de l'Unistra (J. Thompson)

20/01 : Réunion d'organisation du nouveau master Unistra en bioinformatique et bioimagerie structurale, prévu en 2024 (O. Lecompte, J. Thompson)
23/01 : RDA organisational assembly (J. Thompson)

Divers

7/02 : Première session de la formation VSSH (Violence Sexiste et Sexuelle et Homophobe)
21/03 : Deuxième session de la formation VSSH (Violence Sexiste et Sexuelle et Homophobe)

Vie de l'équipe

Réunions d'équipe

Dates fixées à partir du 1er janvier - Début des réunions à 13:30

1er mardi du mois : Réunion groupe A (A-G)
2ème mardi du mois : Réunion groupe B (H-N)
3ème mardi du mois : Réunion groupe C (O-Z)
4ème mardi du mois : Réunion Permanents

Session "Jeun's"

Chaque jeudi à 14:00 : Présentations des "jeunes" pour préparation aux oraux suivies de questions (2 à 3 présentations de 12 min pour stagiaires et doctorants 1ère et 2ème année, 20 min pour doctorants 3ème année).


06/04 : (*) Session "Jeun's" Présentation de Arnaud Kress
06/04 : (*) Session "Jeun's" Présentation de Ihsane Errami
30/03 : (*) Session "Jeun's" Présentation de Corentin Meyer
23/03 : (*) Session "Jeun's" Présentations de Deborah Antonio, Burak Arti, Migena Bejko, Dehelia Chettouf et Julien Schaffer
16/03 : (*) Session "Jeun's" Présentations d'Anne Jeannin-Girardon et Hiba Khodji

23/02 : (*) Réunion pour discuter de l'organisation des présentations