Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

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===Encadrement de stages===
 
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*Réseaux de régulation génétique de lymphocytes B (master, 6 mois, 2017)
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*Réseaux de régulation génétique de lymphocytes B : N. Demeure, M2/ENSIIE, 6 mois, 2017
*Cartes concentriques multi-valuées (2017)
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*Cartes concentriques multi-valuées (a.k.a. Magellan) : F. Delhomme (magistère de maths) et M. Vila (M1 Informatique et Science de l'Image). Co-endadrement : Basile Sauvage, MCF équipe IGG. 3 mois, 2017
  
 
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* Introduction à la programmation web
 
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* Anglais pour l'informatique
 
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* Intelligence artificielle & deep learning
 
* Optimisation stochastique inspirée par la nature
 
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* Évolution artificielle massivement parallèle
 
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==Responsabilités administratives et scientifiques==
 
==Responsabilités administratives et scientifiques==
 
* Membre du Comité d'Experts en informatique 27è section de l'Université de Strasbourg depuis septembre 2016
 
* Membre du Comité d'Experts en informatique 27è section de l'Université de Strasbourg depuis septembre 2016
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* Membre du comité de sélection pour un poste de maître de conférences en informatique à l'IUT Robert Schuman (2017)
 
* Expertise scientifique de dossier de thèse CIFRE pour l'ANRT
 
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* Expertise scientifique pour le pôle de compétitivité BioWin (Wallonie)
  
 
==Contact==
 
==Contact==

Version du 11 juillet 2017 à 09:38

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Recherche

Toutes mes activités de recherche tournent ou ont tourné autour des systèmes complexes et leur étude. Aujourd'hui, je m'intéresse en particulier à l'apprentissage profond (deep learning) et le calcul massivement parallèle. Les domaines d'application de ces recherches sont variés, avec la mise en place d'écosystèmes éducationnels (POEM), d'écosystèmes de calcul (EASEA), d'écosystèmes de santé (HOPE / RADAR), de plateforme de simulation (GEM : Germinal center Modeling), mais aussi d'un écosystème fédérateur, le CS-DC, mutualisant des ressources de recherche et des ressources éducationnelles pour aborder les défis posés par la science des Systèmes Complexes.

Les différentes problématiques que nous étudions sont principalement : l'informatisation robuste et fiables de dossiers médicaux (et, de manière plus générale, de fichiers numériques), la fouille de données, la création de plateformes intelligentes exploitant l'intelligence humaine (détermination de trajectoires éducatives optimales, création de cartes de la connaissance), la sécurisation et détection d'anomalie dans les systèmes d'information.

J'ai aussi quelques petits projets m'intéressant, en cours de définition, bourgeonnant avec paresse mais dont j'espère pouvoir faire quelque chose un jour : pilotage d'algorithmes évolutionnaires par des algorithmes d'apprentissage profond; exploitation de parallélisme massif pour estimer des partitionnements de données non étiquetées; modélisation intégrative de systèmes biologiques; exploration des possibilités de parallélisation avec les principes développés dans EASEA pour l'analyse de séquences ADN issues de séquençage haut débit; ...

Publications

Liste des publications

Implication dans des projets

Cliquez ICI pour quelques anciens projets.

Encadrement scientifique

Encadrement d'étudiants en alternance

Encadrement de stages

  • Réseaux de régulation génétique de lymphocytes B : N. Demeure, M2/ENSIIE, 6 mois, 2017
  • Cartes concentriques multi-valuées (a.k.a. Magellan) : F. Delhomme (magistère de maths) et M. Vila (M1 Informatique et Science de l'Image). Co-endadrement : Basile Sauvage, MCF équipe IGG. 3 mois, 2017

Enseignement

  • Introduction à la programmation web
  • Anglais pour l'informatique
  • Intelligence artificielle & deep learning
  • Optimisation stochastique inspirée par la nature
  • Évolution artificielle massivement parallèle


  • Algorithmique et programmation
  • Certificat informatique et internet
  • Environnements informatiques
  • Langages de programmation
  • Algorithmique fondamentale et graphes
  • Programmation C avancée
  • Java et outillage projet
  • Réseaux IP: concepts, programmation et applications
  • Modélisation cognitive et réactive
  • Compilation, modèles et langages pour les systèmes parallèles

Responsabilités administratives et scientifiques

  • Membre du Comité d'Experts en informatique 27è section de l'Université de Strasbourg depuis septembre 2016
  • Membre du comité de sélection pour un poste de maître de conférences en informatique à l'IUT Robert Schuman (2017)
  • Expertise scientifique de dossier de thèse CIFRE pour l'ANRT
  • Expertise scientifique pour le pôle de compétitivité BioWin (Wallonie)

Contact

Mon bureau est situé au 4 rue Kirschleger, Bâtiment 3 de la Faculté de Médecine au 5è étage (équipe CSTB).

Anne Jeannin-Girardon
ICUBE - UMR CNRS 7357
Tél : +33 (0)3.68.85.45.80 / Fax : +33 (0)3.68.85.44.55
4 rue Kirschleger, 67000 Strasbourg
courriel : Anne.Jeannin @ unistra.Fr