Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

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           https://4pfactory.wordpress.com/4p-factory-workshop-2016-program/
 
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* 17/03 : Meeting Bilan Annuel de l'ANR Infrastructure BIPBIP (25 participants) à Strasbourg (locaux CSTB)
 
* 17/03 : Meeting Bilan Annuel de l'ANR Infrastructure BIPBIP (25 participants) à Strasbourg (locaux CSTB)
* 21/03 :Visite de Amy Gooch (Université de Durham) (du 21/03 au 01/04)
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* 21/03 : Visite de Amy Gooch (Université de Durham) (du 21/03 au 01/04)
 
* 22/03 : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
 
* 22/03 : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
 
* 25/03 : « Science Days » de SANOFI - Journée "L’innovation scientifique au service des patients"   
 
* 25/03 : « Science Days » de SANOFI - Journée "L’innovation scientifique au service des patients"   
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* 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Morgane Gilg (Encadrant J. Thompson)  
 
* 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Morgane Gilg (Encadrant J. Thompson)  
 
* 06/01 : Réunion des permanents du CSTB, debriefing des Bingi Days Retraite de l'équipe
 
* 06/01 : Réunion des permanents du CSTB, debriefing des Bingi Days Retraite de l'équipe
(10 et 11 décembre à la maison des associations à Strasbourg)
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* 11/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Vanessa Fernandes-Cardoso (Encadrant Olivier Poch)  
 
* 11/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Vanessa Fernandes-Cardoso (Encadrant Olivier Poch)  
 
* 18/01 : Réunion budget, regroupement et identification des informations en prévision de l'HCERES
 
* 18/01 : Réunion budget, regroupement et identification des informations en prévision de l'HCERES
 
* 22/01 : présentation des chaires et Unitwin UNESCO-Unistra à l'Institut Lebel (Pierre Collet)
 
* 22/01 : présentation des chaires et Unitwin UNESCO-Unistra à l'Institut Lebel (Pierre Collet)
 
* 25-26/01 : Assemblée générale de l'institut français de bioinformatique, participation aux
 
* 25-26/01 : Assemblée générale de l'institut français de bioinformatique, participation aux
ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la
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            ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la
participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch)
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            participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch)
 
* 27/01 : présentation d'Alexis Allot (ancien thésard)          </nowiki><br />         
 
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'*'*************2015 Equipe BFO ****************'*'
 
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* 9-11 décembre 2015 : Bingi Days, retraite CSTB à la Maison des Associations, place des Orphelins
 
  
* 9 octobre 2015 : Alexis ALLOT a soutenu sa thèse en bioinformatique.
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* 09-11/12/2015 : Bingi Days, retraite CSTB à la Maison des Associations, place des Orphelins
 
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* 09/10/2015 : Alexis ALLOT a soutenu sa thèse en bioinformatique.
* 8 octobre2015 : Carlos BERMEJO DAS NEVES a soutenu sa mi-thèse en bioinformatique.
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* 08/10/2015 : Carlos BERMEJO DAS NEVES a soutenu sa mi-thèse en bioinformatique.
 
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* 01/10/2015 : Arrivées des premiers stagiaires / étudiants de la thèmatique SONIC dans les locaux  
* 1er octobre 2015 : Arrivées des premiers stagiaires / étudiants de la thèmatique SONIC dans les locaux de la Faculté de Médecine.
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              de la Faculté de Médecine.
  
 
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Version du 7 avril 2016 à 10:56

Vie de l'équipe

AVRIL 2016
         
* Publication de "Standardized benchmarking in the quest for orthologs" dans Nature Methods
* 07/04: Cours sur les codes circulaires dans les gènes à l'Ecole des Jeunes Chercheurs en Informatique Mathématiques (EJCIM 16) (C. Michel)
 
MARS 2016
         
 Les réunions d'équipe hebdomadaires se dérouleront le mardi à 14h à partir de Mars.
 L'ordre des présentations des groupes reste inchangé. 
 Programmation des réunions des permanents tous les premiers Mardis du mois.

* 03/03 : réunion préparation de l'HCERES, bilan sur le wiki CSTB
* 08/03 : ELIXIR All Hands meeting Barcelone 7-9 Mars (participants J. Thompson/O. Poch) 
           https://www.elixir-europe.org/events/elixir-all-hands-2016
* 11/03 : présentation Systèmes immunitaires artificiels par Cédric Pupka vendredi à 14h (Encadrant P. Parrend)
* 15/03 : Arrivée Stagiaire Anna Leontova (Encadrant J. Thompson)
* 16/03 : 4P Factory workshop, 4P-Factory e-room + Grand Amphi de Math Unistra (P. Parrend)    
           https://4pfactory.wordpress.com/4p-factory-workshop-2016-program/
* 17/03 : Meeting Bilan Annuel de l'ANR Infrastructure BIPBIP (25 participants) à Strasbourg (locaux CSTB)
* 21/03 : Visite de Amy Gooch (Université de Durham) (du 21/03 au 01/04)
* 22/03 : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
* 25/03 : « Science Days » de SANOFI - Journée "L’innovation scientifique au service des patients"  
          Présentation  Poster VarScrut Centre de Congrès, Le Port-Marly (78) (O. Poch)
* 31/03 : Visite Introduction à la recherche (étudiants de L3)         
* Déplacement de P. Collet à Bakou pour le montage d'une nouvelle université, 
          l'Université Franco-Azerbaïdjanaise (UFAZ)
* Finalisation du volume Springer Proceedings in Complexity 
          ''First Complex Systems Digital Campus World E-Conference 2015'' (Edits P.Bourgine, P.Collet, P.Parrend).
* 2 Papiers acceptés à CEC et Gecco : 
** CEC'16: Author(s):  Jean Meunier, Julier Rohmer, Dominique Knittel and Pierre Collet
          Title: Metaheuristic Based Battery Control Optimization of a Photovoltaic System with Grid Connexion
** GECCO'16: Author(s): N. Hamze, P. Collet, and C. Essert
          Title: Introducing Pareto-based MOEA to Neurosurgery Preoperative Path Planning
 
FEVRIER 2016 * 2 ANR sur 3 ont passé la phase 1 * papier EvoBio accepté: Authors: Elise Rosati, Morgan Made, Abir Rezgui, Quentin Colman, Nicolas Toussaint, Christophe Lallement, Pierre Collet Title: Application of Evolutionary Algorithms for the Optimization of Genetic Regulatory Networks * 12/02 : réunion SATT Connectus, Licence VarScrut * 22/02 : Arrivée Stagiaire Master Cédric Pupka (Encadrant Pierre Parrend) * 25/02 : AG ICube
JANVIER 2016
         
 Les réunions d'équipe hebdomadaires du mercredi se dérouleront le Jeudi à partir de
Janvier, l'ordre des présentations des groupes reste inchangé.
* 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Hélène Gass (Encadrant J. Thompson) 
* 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Morgane Gilg (Encadrant J. Thompson) 
* 06/01 : Réunion des permanents du CSTB, debriefing des Bingi Days Retraite de l'équipe
          (10 et 11 décembre à la maison des associations à Strasbourg)
* 11/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Vanessa Fernandes-Cardoso (Encadrant Olivier Poch) 
* 18/01 : Réunion budget, regroupement et identification des informations en prévision de l'HCERES
* 22/01 : présentation des chaires et Unitwin UNESCO-Unistra à l'Institut Lebel (Pierre Collet)
* 25-26/01 : Assemblée générale de l'institut français de bioinformatique, participation aux
             ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la
             participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch)
* 27/01 : présentation d'Alexis Allot (ancien thésard)          

'*'*************2015 Equipe BFO ****************'*'

  • 09-11/12/2015 : Bingi Days, retraite CSTB à la Maison des Associations, place des Orphelins
  • 09/10/2015 : Alexis ALLOT a soutenu sa thèse en bioinformatique.
  • 08/10/2015 : Carlos BERMEJO DAS NEVES a soutenu sa mi-thèse en bioinformatique.
  • 01/10/2015 : Arrivées des premiers stagiaires / étudiants de la thèmatique SONIC dans les locaux
              de la Faculté de Médecine.


Réunions d'équipe

Le mardi de 14h00 à 15h, Salle 526, Faculté de Médecine, CSTB 5e étage - 11 rue Humann

2016

Avril

  • 05 avril : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Bilan des présentations stagiaires /concours / mi-thèse à venir

Mars

  • 29 mars : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
  • 22 mars : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
  • 15 mars : Présentation des travaux, groupe B
  • 08 mars : Présentation des travaux, groupe A
  • 03 mars : Réunion préparatoire de l'HCERES
  • 01 mars : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Liste des points à aborder à la réunion préparatoire de l'HCERES le 03 mars
    • Bilan des entrées/sorties au CSTB
    • Bilan des financements

Février

  • 24 février : Présentation des travaux, groupe B
  • 17 février : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
  • 10 février : Présentation des travaux, groupe A
  • 04 février : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Bilan des activités de janvier : a- CR ComDir Icube du 01/02, b- CR AG IFB du 26/01.
    • Finances/appels d'offre
    • Divers

Janvier

  • 28 janvier : Présentation des travaux, groupe B
  • 20 janvier : Présentation des travaux, groupe A
  • 13 janvier : Présentation skype de Salma Aouled El Haj
  • 06 janvier : Réunion des permanents :
    • Préparation HCERES
    • Debriefing Bingi Days
    • Financements

2015

Décembre

  • 16 décembre: Présentation de Nicolas Lachiche ‘clowdflows : an open sourced cloud based platform for composition, execution, and sharing of interactive machine learning and data mining workflows’.
  • 9-11 décembre: Bingi Days, retraite CSTB
  • 02 décembre: Troisième réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB

Novembre

  • 27 novembre : Présentation des travaux, groupe A
  • 19 novembre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
  • 11 novembre : Férié
  • 4 novembre : Seconde réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB

Octobre

  • 28 octobre : Présentation des travaux, groupe B
  • 21 octobre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
  • 14 octobre : Première réunion de toute l'équipe CSTB
  • 7 octobre : Première réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB