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| − | + | * Publication de "Standardized benchmarking in the quest for orthologs" dans Nature Methods | |
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| − | + | Les réunions d'équipe hebdomadaires se dérouleront le mardi à 14h à partir de Mars. | |
| − | L'ordre des présentations des groupes reste inchangé. | + | L'ordre des présentations des groupes reste inchangé. |
| − | Programmation des réunions des permanents tous les premiers Mardis du mois. | + | Programmation des réunions des permanents tous les premiers Mardis du mois. |
| − | + | * 03/03 : réunion préparation de l'HCERES, bilan sur le wiki CSTB | |
| − | + | * 08/03 : ELIXIR All Hands meeting Barcelone 7-9 Mars (participants J. Thompson/O. Poch) | |
https://www.elixir-europe.org/events/elixir-all-hands-2016 | https://www.elixir-europe.org/events/elixir-all-hands-2016 | ||
| − | + | * 11/03 : présentation Systèmes immunitaires artificiels par Cédric Pupka vendredi à 14h (Encadrant P. Parrend) | |
| − | + | * 15/03 : Arrivée Stagiaire Anna Leontova (Encadrant J. Thompson) | |
| − | + | * 16/03 : 4P Factory workshop, 4P-Factory e-room + Grand Amphi de Math Unistra (P. Parrend) | |
https://4pfactory.wordpress.com/4p-factory-workshop-2016-program/ | https://4pfactory.wordpress.com/4p-factory-workshop-2016-program/ | ||
| − | + | * 17/03 : Meeting Bilan Annuel de l'ANR Infrastructure BIPBIP (21 participants) à Strasbourg (locaux CSTB) | |
| − | + | * 22/03 : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI | |
| − | + | * 25/03 : Journée "L’innovation scientifique au service des patients" | |
journées « Science Days » de SANOFI Présentation Poster VarScrut Paris | journées « Science Days » de SANOFI Présentation Poster VarScrut Paris | ||
Centre de Congrès Les Pyramides, Le Port-Marly (78) (O. Poch) | Centre de Congrès Les Pyramides, Le Port-Marly (78) (O. Poch) | ||
| − | + | * 31/03 : Visite Introduction à la recherche (étudiants de L3) | |
| − | + | * Déplacement de P. Collet à Bakou pour le montage d'une nouvelle université, l'Université Franco-Azerbaïdjanaise (UFAZ) | |
| − | + | * Visite de Amy Gooch (Université de Durham) du 21 mars au 1er avril | |
| − | + | * Finalisation du volume Springer Proceedings in Complexity ''First Complex Systems Digital Campus World E-Conference 2015'' (Editors P. Bourgine, P. Collet, P. Parrend). | |
| + | * Papiers acceptés à Gecco et CEC | ||
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| − | + | * 2 ANR sur 3 ont passé la phase 1 | |
| − | + | * papier EvoBio accepté | |
| − | + | * 12/02 : réunion SATT Connectus, Licence VarScrut | |
| − | + | * 22/02 : Arrivée Stagiaire Master Cédric Pupka (Encadrant Pierre Parrend) | |
| − | + | * 25/02 : AG ICube </nowiki><br /> | |
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| − | + | Les réunions d'équipe hebdomadaires du mercredi se dérouleront le Jeudi à partir de | |
Janvier, l'ordre des présentations des groupes reste inchangé. | Janvier, l'ordre des présentations des groupes reste inchangé. | ||
| − | + | * 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Hélène Gass (Encadrant J. Thompson) | |
| − | + | * 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Morgane Gilg (Encadrant J. Thompson) | |
| − | + | * 06/01 : Réunion des permanents du CSTB, debriefing des Bingi Days Retraite de l'équipe | |
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(10 et 11 décembre à la maison des associations à Strasbourg) | (10 et 11 décembre à la maison des associations à Strasbourg) | ||
| − | + | * 11/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Vanessa Fernandes-Cardoso (Encadrant Olivier Poch) | |
| − | + | * 18/01 : Réunion budget, regroupement et identification des informations en prévision de l'HCERES | |
| − | + | * 22/01 : présentation des chaires et Unitwin UNESCO-Unistra à l'Institut Lebel (Pierre Collet) | |
| − | + | * 25-26/01 : Assemblée générale de l'institut français de bioinformatique, participation aux | |
ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la | ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la | ||
participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch) | participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch) | ||
| − | + | * 27/01 : présentation d'Alexis Allot (ancien thésard) </nowiki><br /> | |
'*'*************2015 Equipe BFO ****************'*' | '*'*************2015 Equipe BFO ****************'*' | ||
Version du 6 avril 2016 à 17:50
Vie de l'équipe
AVRIL 2016
* Publication de "Standardized benchmarking in the quest for orthologs" dans Nature Methods
MARS 2016
Les réunions d'équipe hebdomadaires se dérouleront le mardi à 14h à partir de Mars.
L'ordre des présentations des groupes reste inchangé.
Programmation des réunions des permanents tous les premiers Mardis du mois.
* 03/03 : réunion préparation de l'HCERES, bilan sur le wiki CSTB
* 08/03 : ELIXIR All Hands meeting Barcelone 7-9 Mars (participants J. Thompson/O. Poch)
https://www.elixir-europe.org/events/elixir-all-hands-2016
* 11/03 : présentation Systèmes immunitaires artificiels par Cédric Pupka vendredi à 14h (Encadrant P. Parrend)
* 15/03 : Arrivée Stagiaire Anna Leontova (Encadrant J. Thompson)
* 16/03 : 4P Factory workshop, 4P-Factory e-room + Grand Amphi de Math Unistra (P. Parrend)
https://4pfactory.wordpress.com/4p-factory-workshop-2016-program/
* 17/03 : Meeting Bilan Annuel de l'ANR Infrastructure BIPBIP (21 participants) à Strasbourg (locaux CSTB)
* 22/03 : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
* 25/03 : Journée "L’innovation scientifique au service des patients"
journées « Science Days » de SANOFI Présentation Poster VarScrut Paris
Centre de Congrès Les Pyramides, Le Port-Marly (78) (O. Poch)
* 31/03 : Visite Introduction à la recherche (étudiants de L3)
* Déplacement de P. Collet à Bakou pour le montage d'une nouvelle université, l'Université Franco-Azerbaïdjanaise (UFAZ)
* Visite de Amy Gooch (Université de Durham) du 21 mars au 1er avril
* Finalisation du volume Springer Proceedings in Complexity ''First Complex Systems Digital Campus World E-Conference 2015'' (Editors P. Bourgine, P. Collet, P. Parrend).
* Papiers acceptés à Gecco et CEC
FEVRIER 2016
* 2 ANR sur 3 ont passé la phase 1
* papier EvoBio accepté
* 12/02 : réunion SATT Connectus, Licence VarScrut
* 22/02 : Arrivée Stagiaire Master Cédric Pupka (Encadrant Pierre Parrend)
* 25/02 : AG ICube
JANVIER 2016
Les réunions d'équipe hebdomadaires du mercredi se dérouleront le Jeudi à partir de
Janvier, l'ordre des présentations des groupes reste inchangé.
* 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Hélène Gass (Encadrant J. Thompson)
* 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Morgane Gilg (Encadrant J. Thompson)
* 06/01 : Réunion des permanents du CSTB, debriefing des Bingi Days Retraite de l'équipe
(10 et 11 décembre à la maison des associations à Strasbourg)
* 11/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Vanessa Fernandes-Cardoso (Encadrant Olivier Poch)
* 18/01 : Réunion budget, regroupement et identification des informations en prévision de l'HCERES
* 22/01 : présentation des chaires et Unitwin UNESCO-Unistra à l'Institut Lebel (Pierre Collet)
* 25-26/01 : Assemblée générale de l'institut français de bioinformatique, participation aux
ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la
participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch)
* 27/01 : présentation d'Alexis Allot (ancien thésard)
'*'*************2015 Equipe BFO ****************'*'
- 9-11 décembre 2015 : Bingi Days, retraite CSTB à la Maison des Associations, place des Orphelins
- 9 octobre 2015 : Alexis ALLOT a soutenu sa thèse en bioinformatique.
- 8 octobre2015 : Carlos BERMEJO DAS NEVES a soutenu sa mi-thèse en bioinformatique.
- 1er octobre 2015 : Arrivées des premiers stagiaires / étudiants de la thèmatique SONIC dans les locaux de la Faculté de Médecine.
Réunions d'équipe
Le mardi de 14h00 à 15h, Salle 526, Faculté de Médecine, CSTB 5e étage - 11 rue Humann
2016
Avril
- 05 avril : Réunion des permanents :
- Préparation des réunions hebdomadaires
- Bilan des présentations stagiaires /concours / mi-thèse à venir
Mars
- 29 mars : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
- 22 mars : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
- 15 mars : Présentation des travaux, groupe B
- 08 mars : Présentation des travaux, groupe A
- 03 mars : Réunion préparatoire de l'HCERES
- 01 mars : Réunion des permanents :
- Préparation des réunions hebdomadaires
- Liste des points à aborder à la réunion préparatoire de l'HCERES le 03 mars
- Bilan des entrées/sorties au CSTB
- Bilan des financements
Février
- 24 février : Présentation des travaux, groupe B
- 17 février : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
- 10 février : Présentation des travaux, groupe A
- 04 février : Réunion des permanents :
- Préparation des réunions hebdomadaires
- Bilan des activités de janvier : a- CR ComDir Icube du 01/02, b- CR AG IFB du 26/01.
- Finances/appels d'offre
- Divers
Janvier
- 28 janvier : Présentation des travaux, groupe B
- 20 janvier : Présentation des travaux, groupe A
- 13 janvier : Présentation skype de Salma Aouled El Haj
- 06 janvier : Réunion des permanents :
- Préparation HCERES
- Debriefing Bingi Days
- Financements
2015
Décembre
- 16 décembre: Présentation de Nicolas Lachiche ‘clowdflows : an open sourced cloud based platform for composition, execution, and sharing of interactive machine learning and data mining workflows’.
- 9-11 décembre: Bingi Days, retraite CSTB
- 02 décembre: Troisième réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB
Novembre
- 27 novembre : Présentation des travaux, groupe A
- 19 novembre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
- 11 novembre : Férié
- 4 novembre : Seconde réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB
Octobre
- 28 octobre : Présentation des travaux, groupe B
- 21 octobre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
- 14 octobre : Première réunion de toute l'équipe CSTB
- 7 octobre : Première réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB