Équipe CSTB : Systèmes Complexes et Bioinformatique Translationnelle

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* 1er octobre 2015 : Arrivées des premiers stagiaires / étudiants de la thèmatique SONIC dans les locaux de la Faculté de Médecine.
 
* 1er octobre 2015 : Arrivées des premiers stagiaires / étudiants de la thèmatique SONIC dans les locaux de la Faculté de Médecine.
  
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__NOTOC__
 
==Réunions d'équipe==
 
==Réunions d'équipe==
  
 
Le mardi de 14h00 à 15h, Salle 526, Faculté de Médecine, CSTB 5e étage - 11 rue Humann
 
Le mardi de 14h00 à 15h, Salle 526, Faculté de Médecine, CSTB 5e étage - 11 rue Humann
  
2016<br />
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=== 2016 ===
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==== Avril ====
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* 05 avril : Réunion des permanents :
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** ''Préparation des réunions hebdomadaires''
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** ''Bilan des présentations stagiaires /concours / mi-thèse à venir''
  
** 05 avril : Réunion des permanents :  
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==== Mars====
          <nowiki>
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* 29 mars : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
        1- Préparation des réunions hebdomadaires
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* 22 mars : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
        2- Bilan des présentations stagiaires /concours / mi-thèse a venir
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* 15 mars : Présentation des travaux, groupe B
          </nowiki><br />       
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* 08 mars : Présentation des travaux, groupe A
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* 03 mars : Réunion préparatoire de l'HCERES
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* 01 mars : Réunion des permanents :  
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** ''Préparation des réunions hebdomadaires''
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** ''Liste des points à aborder à la réunion préparatoire de l'HCERES le 03 mars
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** ''Bilan des entrées/sorties au CSTB''
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** ''Bilan des financements''
  
** 29 mars : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
+
==== Février====
** 22 mars : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
+
* 24 février : Présentation des travaux, groupe B
** 15 mars : Présentation des travaux, groupe B
+
* 17 février : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
** 08 mars : Présentation des travaux, groupe A
+
* 10 février : Présentation des travaux, groupe A
** 03 mars : Réunion préparatoire de l'HCERES
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* 04 février : Réunion des permanents :
** 01 mars : Réunion des permanents :  
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** ''Préparation des réunions hebdomadaires''
          <nowiki>
+
** ''Bilan des activités de janvier : a- CR ComDir Icube du 01/02, b- CR AG IFB du 26/01.''
        1- Préparation des réunions hebdomadaires
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** ''Finances/appels d'offre''
        2- Liste des points à aborder à la réunion préparatoire de l'HCERES le 03 mars
+
** ''Divers''
        3- Bilan des entrées/sorties au CSTB
 
        4- Bilan des financements
 
          </nowiki><br />       
 
  
** 24 février : Présentation des travaux, groupe B
+
==== Janvier====
** 17 février : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
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* 28 janvier : Présentation des travaux, groupe B
** 10 février : Présentation des travaux, groupe A
+
* 20 janvier : Présentation des travaux, groupe A
** 04 février : Réunion des permanents :
+
* 13 janvier : Présentation skype de Salma Aouled El Haj
          <nowiki>1- Préparation des réunions hebdomadaires
+
* 06 janvier : Réunion des permanents :
        2- Bilan des activités de janvier : a- CR ComDir Icube du 01/02, b- CR AG IFB du 26/01.
+
** ''Préparation HCERES''
        3- Finances/appels d'offre
+
** ''Debriefing Bingi Days''
        4- Divers</nowiki><br />
+
** ''Financements''
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=== 2015 ===
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==== Décembre====
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* 16 décembre: Présentation de Nicolas Lachiche ‘clowdflows : an open sourced cloud based platform for composition, execution, and sharing of interactive machine learning and data mining workflows’.  
 +
* 9-11 décembre: Bingi Days, retraite CSTB
 +
* 02 décembre: Troisième réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB
 +
==== Novembre====
 +
* 27 novembre : Présentation des travaux, groupe A
 +
* 19 novembre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
 +
* 11 novembre : Férié
 +
* 4 novembre : Seconde réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB
 +
==== Octobre====
 +
* 28 octobre : Présentation des travaux, groupe B
 +
* 21 octobre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
 +
* 14 octobre : Première réunion de toute l'équipe CSTB
 +
* 7 octobre : Première réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB
  
** 28 janvier : Présentation des travaux, groupe B
 
** 20 janvier : Présentation des travaux, groupe A
 
** 13 janvier : Présentation skype de Salma Aouled El Haj
 
** 06 janvier : Réunion des permanents :
 
          <nowiki>1- Préparation HCERES
 
        2- Debriefing Bingi Days
 
        3- Financements</nowiki>
 
2015
 
 
** 16 décembre: Présentation de Nicolas Lachiche ‘clowdflows : an open sourced cloud based platform for composition, execution, and sharing of interactive machine learning and data mining workflows’.
 
** 9-11 décembre: Bingi Days, retraite CSTB
 
** 02 décembre: Troisième réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB
 
 
** 27 novembre : Présentation des travaux, groupe A
 
** 19 novembre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
 
** 11 novembre : Férié
 
** 4 novembre : Seconde réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB
 
 
** 28 octobre : Présentation des travaux, groupe B
 
** 21 octobre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
 
** 14 octobre : Première réunion de toute l'équipe CSTB
 
** 7 octobre : Première réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB
 
 
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Version du 6 avril 2016 à 17:28

Vie de l'équipe

AVRIL 2016
         
o Publication de "Standardized benchmarking in the quest for orthologs" dans Nature Methods
 
MARS 2016
         
o Les réunions d'équipe hebdomadaires se dérouleront le mardi à 14h à partir de Mars.
L'ordre des présentations des groupes reste inchangé. 
Programmation des réunions des permanents tous les premiers Mardis du mois.

** 03/03 : réunion préparation de l'HCERES, bilan sur le wiki CSTB
** 08/03 : ELIXIR All Hands meeting Barcelone 7-9 Mars (participants J. Thompson/O. Poch) 
           https://www.elixir-europe.org/events/elixir-all-hands-2016
** 11/03 : présentation Systèmes immunitaires artificiels par Cédric Pupka vendredi à 14h (Encadrant P. Parrend)
** 15/03 : Arrivée Stagiaire Anna Leontova (Encadrant J. Thompson)
** 16/03 : 4P Factory workshop, 4P-Factory e-room + Grand Amphi de Math Unistra (P. Parrend)    
           https://4pfactory.wordpress.com/4p-factory-workshop-2016-program/
** 17/03 : Meeting Bilan Annuel de l'ANR Infrastructure BIPBIP (21 participants) à Strasbourg (locaux CSTB)
** 22/03 : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
** 25/03 : Journée "L’innovation scientifique au service des patients" 
journées « Science Days » de SANOFI Présentation Poster VarScrut Paris 
Centre de Congrès Les Pyramides, Le Port-Marly (78) (O. Poch)
** 31/03 : Visite Introduction à la recherche (étudiants de L3)          
FEVRIER 2016
         
o 2 ANR sur 3 ont passé la phase 1
o papier EvoBio accepté

** 12/02 : réunion SATT Connectus, Licence VarScrut
** 22/02 : Arrivée Stagiaire Master Cédric Pupka (Encadrant Pierre Parrend)
** 25/02 : AG ICube          
JANVIER 2016
         
o Les réunions d'équipe hebdomadaires du mercredi se dérouleront le Jeudi à partir de
Janvier, l'ordre des présentations des groupes reste inchangé.

** 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Hélène Gass (Encadrant J. Thompson) 
** 04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Morgane Gilg (Encadrant J. Thompson) 
** 06/01 : Réunion des permanents du CSTB, debriefing des Bingi Days Retraite de l'équipe
(10 et 11 décembre à la maison des associations à Strasbourg)
** 11/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Vanessa Fernandes-Cardoso (Encadrant Olivier Poch) 
** 18/01 : Réunion budget, regroupement et identification des informations en prévision de l'HCERES
** 22/01 : présentation des chaires et Unitwin UNESCO-Unistra à l'Institut Lebel (Pierre Collet)
** 25-26/01 : Assemblée générale de l'institut français de bioinformatique, participation aux
ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la
participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch)
** 27/01 : présentation d'Alexis Allot (ancien thésard)          

'*'*************2015 Equipe BFO ****************'*'

  • 9-11 décembre 2015 : Bingi Days, retraite CSTB à la Maison des Associations, place des Orphelins
  • 9 octobre 2015 : Alexis ALLOT a soutenu sa thèse en bioinformatique.
  • 8 octobre2015 : Carlos BERMEJO DAS NEVES a soutenu sa mi-thèse en bioinformatique.
  • 1er octobre 2015 : Arrivées des premiers stagiaires / étudiants de la thèmatique SONIC dans les locaux de la Faculté de Médecine.


Réunions d'équipe

Le mardi de 14h00 à 15h, Salle 526, Faculté de Médecine, CSTB 5e étage - 11 rue Humann

2016

Avril

  • 05 avril : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Bilan des présentations stagiaires /concours / mi-thèse à venir

Mars

  • 29 mars : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
  • 22 mars : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI
  • 15 mars : Présentation des travaux, groupe B
  • 08 mars : Présentation des travaux, groupe A
  • 03 mars : Réunion préparatoire de l'HCERES
  • 01 mars : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Liste des points à aborder à la réunion préparatoire de l'HCERES le 03 mars
    • Bilan des entrées/sorties au CSTB
    • Bilan des financements

Février

  • 24 février : Présentation des travaux, groupe B
  • 17 février : JournalClub, présentations rapides de publications jugées intéressantes
  • 10 février : Présentation des travaux, groupe A
  • 04 février : Réunion des permanents :
    • Préparation des réunions hebdomadaires
    • Bilan des activités de janvier : a- CR ComDir Icube du 01/02, b- CR AG IFB du 26/01.
    • Finances/appels d'offre
    • Divers

Janvier

  • 28 janvier : Présentation des travaux, groupe B
  • 20 janvier : Présentation des travaux, groupe A
  • 13 janvier : Présentation skype de Salma Aouled El Haj
  • 06 janvier : Réunion des permanents :
    • Préparation HCERES
    • Debriefing Bingi Days
    • Financements

2015

Décembre

  • 16 décembre: Présentation de Nicolas Lachiche ‘clowdflows : an open sourced cloud based platform for composition, execution, and sharing of interactive machine learning and data mining workflows’.
  • 9-11 décembre: Bingi Days, retraite CSTB
  • 02 décembre: Troisième réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB

Novembre

  • 27 novembre : Présentation des travaux, groupe A
  • 19 novembre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
  • 11 novembre : Férié
  • 4 novembre : Seconde réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB

Octobre

  • 28 octobre : Présentation des travaux, groupe B
  • 21 octobre : Journal club (articles à déposer pour mardi soir)
  • 14 octobre : Première réunion de toute l'équipe CSTB
  • 7 octobre : Première réunion préparatoire des permanents de l'équipe CSTB