Activites 2017

Activités de l'équipe en 2017 | Archives | Année courante

Activités scientifiques des membres

08/12 : Présentation de Claudine Mayer "Structural insights in topoisomerase"
08/12 : Présentation de Jean-Sébastien Sereni : "Graph Theory: a touch of colouring"
12/12 : Soutenance d'HDR de Pierre Parrend " Emergent Industrial Ecosystems/Systèmes industriels émergents" (Garant Pierre Collet)

05-08/11 : Colloque du L.I.A. STRUCO à Strasbourg, co-organisé par P. Charbit & J.-S. Sereni.
21/11 : workshop 4P Factory à Strasbourg, co-organisé par Pierre Parrend
26-28/11 : Participation de Christian Michel au Kick off-Event CAMMBIO (Kompetenzzentrum für algorithmische und mathematische Methoden in der Biologie, Biotechnologie und Medizin) à Mannheim, Allemagne
29/11 : Journée Charles Hermite "Complexité :Théorie des graphes et théorie des nombres", organisée par M. Madritsch, C. Raïssi, J.-S. Sereni et T. Stoll

11/10 : Meeting Projet Médecine Connectée, David Bruchlen ScienceMeUp
23/10 : Meeting rare disease Linked Data and Ontology Task Force (LDOTF) Elixir 2
24-25/10 : Workshop Final ANR Infrastructure BIPBIP: Paris présentation WP/CSTB
25-27/10 : 13th Biennial International Conference on Artificial Evolution, Paris. Participation de Pierre Collet, Anne Jeannin-Girardon, Pierre Parrend.

01/09 : Participation de Pierre Collet au Global Positive Forum à Paris,sous le haut patronage du Président de la République.
05/09 : Keynote de Pierre Collet à la conférence KES 2017 à Marseille : http://kes2017.kesinternational.org/index.php
12/09 : Démarrage du projet HOPE avec présentation des projets Genida et Radar
14/09 : Présentation d'Anne Jeannin-Girardon sur "Estimation de paramètres pour la modélisation de réponses immunitaires" au séminaire SimCells à Brest
12-15/09 : Participation de Yannis Nevers à la conférence 13th [BC]2 Basel Computational Biology Conférence à Bâle
17-22/09 : Participation de Kirsley Chennen au BYOD "Rare Disease Registries" d'Elixir-Excelerate à Rome

03-06/07 : Participation de Yannis Nevers aux journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques et à la rencontre annuelle des jeunes bioinformaticiens à Lille
06-07/07 : Séminaire d'Olivier Poch au colloque "Traitement informatique de larges données en Biologies" à Tours.
11-17/07 : Présentation de POEM à Taipei,Taïwan par Pierre Collet
16-22/07 : Participation de Catherine Guth et Anne Jeannin-Girardon à l'international school of deep learning à Bilbao, Espagne
17-25/07 : Déplacement de Pierre Collet à Osaka, Japon dans le cadre de la collaboration du projet EASEA Cloud

08-10/06 : Participation d'Odile Lecompte au 5th international quest for orthologs meeting et au symposium on evolution of gene families, Los Angeles, CA, USA
12/06 : Pierre Collet anime une table ronde "Deep or wide? Analytics, personnel, and scientific inquiry in an era of disposable data" à la 7th Bioinformatics strategy meeting à Londres
14/06 : Démonstration de POMEv2 par Isaac Abtosi et Pierre Collet
20-26/06: Présentation de POEM à Taipei,Taïwan par Isaac Abtosi et Pierre Collet
25/06 : Tutoriel portant sur le Deep Learning à la conférence IEEE NEWCAS'17 (Strasbourg) par Anne Jeannin

08-12/05: Présentations de Pierre Willaume et Aline Deruyver à la 15e IAPR International Conference on Machine Vision Applications à Nagoya, Japon.
10-12/05 : 1er workshop 'Bring Your Own Data" BOYD sur "Cilipathies resources in Strasbourg" de l'infrastructure Européenne Elixir, (http://www.elixir-europe.org/events/bring-your-own-data-byod-workshop-ciliopathies-resources) organisé à Strasbourg par K. Chennen, O. Poch et J. Thompson, avec la participation des experts du nœud suisse.
31/05 : Présentations de Dylan Durand, stagiaire DUT (encadrant J. Thompson) et de Yasmina Jaafra, doctorante (co-directrice: Aline Deruyver)

25/04 : Workshop "système immunitaires" organisé par Pierre Parrend au CSTB, présentations de Véronique Thomas-Vaslin, Julio Navarro Lara, Fabio Guigou, Pierre Masai.
28/04 : Participation d'Olivier Poch et Julie Thompson à la réunion IFB-Elixir "projet H2025" à l'Institut Pasteur à Paris

07/03 : séminaire de Kirsley Chennen au Swiss Institute of Bioinformatics de Genève sur "Bioanalyses & software development in the field of rare disease: initiatives for the deciphering of the ciliary function and cilipathies". Recherche de nouveaux partenaires dans le cadre de l'organisation des BYODs de l'infrastructure Elixir-Excelerate.
08/03 : conférence de Christian Michel sur la bioinformatique théorique aux enseignants ISN de l'Académie de Strasbourg

23/02 : TedX AE + AI: the way towards autonomous computers, Pierre Collet
28/03 : (*) Kickoff meeting projet ANR DUNE EOLE

14/02 : Séminaire interne sur : "Systèmes immunitaires artificiels", présentations de Pierre Parrend, Anne Jeannin, Pierre Masai, Fabio Guigou, Julio Navarro Lara

24/01 : Présentation de Yannis Nevers à la journée de rencontres autour de la bioinformatique organisée par la plateforme BIstrO de l'IFB
25/01 : Présentation de Pierre Collet sur "Les systèmes complexes : une nouvelle science née au XXe siècle" dans le cadre des conférences de l'IREM.

Visiteurs

25--29/09 : visite de Z. Dvořák et J. Pekárek dans le cadre du L.I.A. STRUCO. (Collaboration Jean-Sébastien Sereni.)
29/09 : Séminaire invité, Dr. Daniel T. Jones sur "Lean as management system for the future" Lean Enterprise Academy, Herefordshire, UK

13/07 : Séminaire invité, Dr. Pascal Barbry, Directeur IPMC Sophia Antipolis sur : Regulation of multiciliogenesis by non coding RNAs

Doctorats

01/12 : Arrivée de Clément Schreiner, doctorant (directeur de thèse, Pierre Collet)
01/12 : Arrivée d'Ulviya Abdulkarimova, doctorante (directeur de thèse Erik-André Sauleau, co-directeur Pierre Collet)
11/12 : Soutenance de thèse de Pierre Willaume "Modélisation de formes 3D par les graphes pour leur reconnaissance. Application à la vision 3D en robotique dans des tâches de Pick-and-Place" (directrice de thèse Aline Deruyver)

01/10 : Arrivée d'Audrey Defosset, doctorante, directrice de thèse Odile Lecompte
01/10 : Arrivée de Gopal Krishna Dila, doctorant, directeur de thèse Christian Michel
01/10 : Arrivée de François Pirot, doctorant, Directeurs de thèse M. Couceiro & J.-S. Sereni, Université de Lorraine, 02/18 co-directeur de thèse Jean-Sébastien Sereni.

29/09 : Soutenance de thèse de Pierre Masai sur "Modeling the lean organization as a complex system", Directeur de thèse, Pierre Collet

27/06 : soutenance mi-these de Julio Navarro Lara et Fabio Guigou
28/06 : soutenance mi-thèse de Yannis Nevers, directrice de thèse Odile Lecompte

21/04 : Arrivée de Yasmina Jaafra, doctorante (co-directeurs de thèse : Aline Deruyver ; Mohamed Saber Naseur de l'Université de La Manouba, Tunisie)

24/01 : Thèse en informatique de Karim El Soufi sur :"Study of circular code motifs in nucleic acid sequences", sous la direction de Christian Michel

Stages

06/11 : Arrivée de Clémentine Leporcq, stagiaire M2 encadrée par Julie Thompson
06/11 : Arrivée de Quentin Rott, stagiaire M2, encadré par Julie Thompson
06/11 : Arrivée de Thomas Weber, stagiaire M2, encadré par Julie Thompson
13/11 : arrivée de Laura Dutto, stagiaire Ingénieur ESBS (encadrant Odile Lecompte)

03/07 : Arrivée de Maxime Grosjean, stagiaire 2année EPITECH, encadré par Luc Moulinier

12/06 : Arrivée de Nicolas Scalzitti, stagiaire M1, encadré par Raymond Ripp
12/06 : Arrivée de Fabien Delhomme, Magistère 2, co-encadré par Anne Jeannin Girardon
26/06 : Arrivée d'Arthur Caillol, de 2ème année, encadré par Pierre Collet

22/05 : Arrivée de Briger Lenz, stagiaire 1ère année ingénieur ESBS, encadré par Raymond Ripp

03/04 : Arrivée de Dylan Durand, stagiaire DUT, encadré par J. Thompson

13/03 : Arrivée de Nicolas Scalzitti, stagiaire M1 BSBB, encadré par Julie Thompson
13/03 : Arrivée d'Asmaoul Housnat SA Thaoubane, stagiaire M1 BSBB, encadré par Julie Thompson
13/03 : Arrivée de Sarah Djeddi, stagiaire M1 BSBB, encadrée par Odile Lecompte
13/03 : Arrivée de Remi Schilling, stagiaire classe 2nd, encadré par Anne Jeannin
20/03 : Arrivée de Paul-Armand Michaud, stagiaire L3 informatique, encadré par Pierre Collet

13/02 : Arrivée de Nestor Demeure, stagiaire ingénieur ENSIIE, encadré par Anne Jeannin-Girardon

02/01 : arrivée de Viviane Nguefack Ngoune, stagiaire M2, encadrée par Julie Thompson
03/01 : arrivée d'Audrey Defosset, stagiaire M2, encadrée par Odile Lecompte

Activités administratives

21/12 : Validation du Projet "CoolMagEvo" par l'ANR (projet de recherche collaborative - entreprise)

13/11 : Pierre Collet élu directeur du GIS Réseau National des Systèmes Complexes (RNSC)(CA-GIS du 13/11)

05/10 : Journée Pôle de Compétitivité au Palais Universitaire (Contact Projet Médecine Connectée, Anna Leonteva)
12/10 : 3 ANR déposées: 1 CSTB porteur, 2 partenaire

19/01 : 3 Appels à Projets Internes ICube 2017 retenus pour le CSTB en inter-équipes dont un en porteur de projet :
Germinal center modeling, (CSTB/SMH), Anne Jeannin CSTB, porteur du projet.
Optim'R BICS (MIV/CSTB/plateforme BICS)
Cartes concentriques multi-valuées (IGG/CSTB)

Divers

13-15/10 : Participation de l'équipe à la Fête de la Science à Strasbourg. Animation d'un stand sur "la nouvelle science des systèmes complexes" pour les scolaires et le grand public. Pierre Collet, Anne Jeannin-Girardon, Julio Navaro Lara, Yannis Nevers, Raymond Ripp.

01/09 : Arrivée de Jean-Sébastien Sereni, Chargé de Recherche CNRS, précédemment au LORIA (Nancy)
01/09 : Julie Thompson est F1000 Faculty member in Bioinformatics, Biomedical Informatics & Computational Biology (https://f1000.com/prime/thefaculty/member/499999771097522671)

15/06 : Pierre Collet Associate Editor de l' Eurasia Journal of Mathematics, Science and Technology Education.

14/04 : Date du BYOD Ciliopathies (Bring Your Own Data) Strasbourg : 10-12 Mai (http://www.elixir-europe.org/events/bring-your-own-data-byod-workshop-ciliopathies-resources)

06/03 : Intégration de Claudine Mayer, Institut Pasteur (Professeur associé)

Vie de l'équipe

Réunions d'équipe

Dates fixées à partir du 1er janvier - Début des réunions à 13:30

1er mercredi du mois : Réunion groupe A (A-M)
2ème mercredi du mois : Journal Club
3ème mercredi du mois : Réunion groupe C (N-Z)
4ème mardi du mois : Réunion Permanents

18/12 : Fête de Noël de l'équipe

28/09 : Pot de bienvenue pour l'arrivée de Jean-Sébastien Sereni, nouveau membre permanent et d'Audrey Defosset et Gopal Krishna Dila, doctorants.

21/06 : Barbecue annuel de l'équipe