Activites 2016

Activités de l'équipe en 2016 | Archives | Année courante

Activités scientifiques des membres

06/12 : Présentation de Yannis Nevers sur les protéomes complets disponibles.
07/12 : Présentation de Julio Navarro Lara au SSCI (Symposium Series on Computational Intelligences) à Athènes.
08/12 : Présentation de Pierre Willaume au SSCI (Symposium Series on Computational Intelligences) à Athènes.
08/12 : Présentation aux "BioWin days" à Louvain-la-Neuve, BELGIQUE (Anne Jeannin-Girardon, Pierre Collet et Olivier Poch).
13/12 : Présentation de Kirsley Chennen sur l'installation d'un web sémantique au CSTB dans le contexte du projet Elixir.

15/11 : Matinée de présentations "deep learning et réseaux de neurones"
16/11 : Yannis Nevers a organisé un rassemblement JeBiF pub à Strasbourg
18/11 : Séminaire invité (Julie Thompson), journée Big Data du Master de Bioinformatique, Université de Rennes
25/11 : Présentations des projets des deux apprentis Master2 ILC, Alexandre Bruyant et Marc Haegelin
28/11 : Elixir conf-call avec Kirsley Chennen, Olivier Poch et Julie Thompson
29/11 : Séminaire d'Anne Jeannin, Pierre Parrend et Pierre Collet au colloque du réseau ImmuniComplexIT à Paris

20-23/09 : Présentation d'un poster par Yannis Nevers au 20th Evolutionary Biology Meeting à Marseille
22/09 : Journée d'échange CSTB avec le Dr. Partap Chauhan autour du projet modélisation médecine Ayurvedique
26/09 : Reprise des téléconférences mensuelles dans le cadre du projet H2020 "Elixir Excelerate"
30/09 : Journée BIONICS organisée par Pierre Parrend au CSTB

23/06 : Conseil scientifique de l'ECAM (Olivier Poch)
28/06 : Présentation de Yannis Nevers aux Journées ouvertes en biologie informatique et mathématiques (JOBIM) à Lyon du 28 au 30 juin. Participation de Salma Aouled El Haj Mohamed.

07/04 : Cours sur les codes circulaires dans les gènes à l'Ecole des Jeunes Chercheurs en Informatique Mathématiques (EJCIM 16) (Christian Michel)
29/04 : Présentations aux quatrièmes journées scientifiques de la Fédération de Médecine Translationnelle Strasbourg (FMTS) de:

Carlos Bermejo Das Neves : "MODEX: An artificial intelligence engine designed for systems biomedicine"
Yannis Nevers : "Prediction and characterization of ciliary proteins by comparative genomics"

08/03 : ELIXIR All Hands meeting Barcelone 7-9 Mars (participants Julie Thompson/Olivier Poch)

https://www.elixir-europe.org/events/elixir-all-hands-2016

16/03 : 4P Factory workshop, 4P-Factory e-room + Grand Amphi de Math Unistra (Pierre Parrend)

https://4pfactory.wordpress.com/4p-factory-workshop-2016-program/

17/03 : Meeting Bilan Annuel de l'ANR Infrastructure BIPBIP à Strasbourg au CSTB Faculté de Médecine (25 participants)
25/03 : « Science Days » de SANOFI - Journée "L’innovation scientifique au service des patients"

Présentation Poster VarScrut Centre de Congrès, Le Port-Marly (78) (Olivier Poch)

26/03 : Déplacement de Pierre Collet à Bakou pour le montage d'une nouvelle université, l'Université Franco-Azerbaïdjanaise (UFAZ)

13/01 : Présentation skype de Salma Aouled El Haj
25-26/01 : Assemblée générale de l'institut français de bioinformatique, participation aux ateliers sur les modèles économiques des plateformes et sur la rentabilité de la participation au projet Infradev "Elixir Excelerate" (Olivier Poch)
27/01 : présentation d'Alexis Allot (ancien thésard) (???)

Visiteurs

28/09 : Visite du Dr. Christian Rolando de l'Université de Lille dans le cadre du projet de Master 2 de Marc Haegelin

21/03 : Visite de Amy Gooch (Université de Durham) (du 21/03 au 01/04)

Doctorats

16/11 : Retour de Salma Aouled El Haj Mohamed pour 2 mois (co-directeur de thèse Julie-Thompson)

14/10 : Thèse en bioinformatique de Kirsley Chennen "Maladies rares et 'Big Data' : solutions bioinformatiques vers une analyse guidée par les connaissances" sous la co-direction d'Olivier Poch & Hélène Dollfus
25/10 : Thèse en médecine de Yvan Herenger (ancien stagiaire) Cataractes congénitales génétiques : apport du séquençage haut débit dans le diagnostic et la prise en charge (???)

23/06 : Soutenance mi-thèse Salma Aouled El Haj Mohamed (co-directeur de thèse Julie-Thompson)

Stages

02/11 : Arrivée d'Audrey Defosset, stagiaire Master 2 BSBB (1 mois), encadrée par Odile Lecompte
02/11 : Arrivée de Vincent Zilliox, stagiaire Master 2 BSBB (1 mois), encadré par Julie Thompson<br /

21/09 : Arrivée d'Alexandre Bruyant, apprenti Master2 ILC
21/09 : Arrivée de Marc Haegelin, apprenti Master2 ILC

01/06 : Arrivée de Laurine Huber, stagiaire L3, encadrée par Pierre Collet
15/06 : Arrivée de Mickaël Wagner, stage observation, encadré par Olivier Poch
27/06 : Présentation mi-parcours de Fantin Mesny (stagiaire d'Odile Lecompte) "Analyse d'interaction des réseaux protéiques"

17/05 : Arrivée de Fantin Mesny, stagiaire ESBS, encadré par Odile Lecompte
30/05 : Arrivée de Mickaël Joly, stagiaire BTS, encadré par Raymond Ripp
31/05 : Présentation de Fantin Mesny (stagiaire d'Odile Lecompte) "Analyse de listes de gènes en bioinformatique"

15/03 : Arrivée d'Anna Leontova, stagiaire, encadrée par Julie Thompson
22/03 : Présentation mi-parcours des 3 stagiaires M2 BSBI

22/02 : Arrivée de Cédric Pupka, stagiaire Master, encadré par Pierre Parrend

04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Hélène Gass (Encadrant Julie Thompson)
04/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Morgane Gilg (Encadrant Julie Thompson)
11/01 : Arrivée Stagiaire Master2 Vanessa Fernandes-Cardoso (Encadrant Olivier Poch)

Activités administratives

25/11 : Présentation du CSTB devant les DAS CNRS (Olivier Poch)

13-14/10 : Présentation de POEM au ministère lors des journées Stratégies du Numérique dans l'Enseignement Supérieur, en France et à l'International au Ministère. La présentation de 15mn peut être visionnée ici.

12/09 : Réunion de gouvernance du CRBS, Olivier Poch

02/06 : Réunion IGMA sur l'informatique du CRBS (Centre de Recherche en Biomédecine de Strasbourg)
07/06 : Présentation du projet UFAZ (Université franco-azerbaïdjanaise) par la présidence (Pierre Collet co-recteur)

11-13/05 : Evaluation ingénieurs INRA (LEAN philosophie, tableau de bord des compétences EPST, message constructif à l'ingénieur) (Olivier Poch)
19/05 : Validation du financement de la thèse de Cédric Pupka par la société SYNOVO
19/05 : Validation du financement d'un apprenti par la fondation N-Light (gestion de la cohorte JIVA Ayurveda)

03/03 : Réunion préparatoire de l'HCERES
03/03 : réunion préparation de l'HCERES, bilan sur le wiki CSTB

12/02 : réunion SATT Connectus, Licence VarScrut
25/02 : AG ICube

18/01 : (*) Réunion budget, regroupement et identification des informations en prévision de l'HCERES
22/01 : présentation des chaires et Unitwin UNESCO-Unistra à l'Institut Lebel (Pierre Collet)

Divers

14/12 : Projet ANR DUNE EOLE accepté. CSTB est partenaire pour POEM.

14/11 : Yannis Nevers est le nouveau représentant des doctorants du CSTB
14/11 : Intégration de Catherine Guth (MCF associé)
28/11 : Présentation du CSTB aux nouveaux entrants d'ICube (Olivier Poch)

15-16/10 : Participation à la Fête de la Science à Strasbourg. Animation d'un stand par Pierre Collet, Anne Jeannin, Pierre Parrend

01/09 : Arrivée d'Anne Jeannin, maître de conférence à l'Université de Strasbourg

08/07 : A la Une de L'Actu n°126 de l'Université de Strasbourg, édition du 08/07/2016.
Hélène Gass, stagiaire Master2 en bioinformatique, classée 4e au championnat du monde 2016 d'apnée (16x 50m). Double championne de France 2015 (record et médaille d'or)

30/06 : Promotion de Pierre Collet au grade de PRCE

12/05 : Classement en n°1 d'Anne Jeannin sur un poste MCF pour l'équipe

28/04 : Visite Introduction à la recherche (étudiants de L3)

Vie de l'équipe

Réunions d'équipe

Dates fixées à partir du 1er janvier - Début des réunions à 13:30

1er jeudi du mois : Réunion groupe A (A-M)
2ème jeudi du mois : Journal Club
3ème jeudi du mois : Réunion groupe C (N-Z)
4ème jeudi du mois : Réunion Permanents

15/12 : Fête de Noël du CSTB et du Laboratoire de Génétique Médicale.

02/09 : Pot de bienvenue pour l'arrivée d'Anne Jeannin et la promotion de Pierre Collet au grade de PRCE

28/06 : Barbecue annuel de l'équipe