BICS Faits Marquants2016

Décembre 2016

• Premier test de calcul massif sur la grille de calcul EGI : lancement de 10 millions de BLAST (recherche de similarité dans des banques de données de séquences protéiques) en 15 jours (en mobilisant jusqu'à 4000 coeurs). Cela représente 500 000 heures (57 années!) de temps CPU, et aura nécessité 100 jours de calcul sur nos ressources locales.

• Une réunion des bioinformaticiens de Strasbourg se tiendra à l'IBMP (12 rue du Général Zimmer, Strasbourg) le 24 janvier, de 9h à 12h30. Entrée gratuite, inscription ici.

• Réunion le 15 déc, work package bioinformatique structurale de l'IFB concernant l'installation d'une machine virtuelle sur le cloud IFB.

• Une nouvelle service est disponible : ShinyStats fournit un accès facile aux analyses statistiques de données de l’assurance maladie de type OpenDAMIR et RSS.

• Une nouvelle service est disponible : Circular Code Search permet de rechercher des codes circulaires dans une séquence ADN / ARN.

Novembre 2016

• Réunion avec les biostaticiens de l'équipe MIV, concernant l'hébergement des services d'analyse statistique (sous R/RStudio) de données médicales.

• Réunion avec la thématique 'bioinformatique théorique', concernant l'hébergement du logiciel 'code circulaire'.

• Préparation de la première journée bioinformatique de Strasbourg (avec la plate-forme BISTRO) en janvier 2017.

• Support aux 2 stagiaires Masters BSBB de l'équipe CSTB

Octobre 2016

• Participation aux projets ANR 2017: GENOMIRCIL, VACCARME et MECAPLAX.

• 21 octobre, Réunion du Comité de Pilotage Externe : bilan des activités au sein de l'IFB, bilan de la plate-forme (participation aux groupes de travail IFB/Elixir) et perspectives pour 2016 (demandes de financement, participation des différents partenaires à BISTRO, organisation d'une journée bioinformatique strasbourgeoise)

Juin 2016

• Une nouvelle service est disponible : POEM donnant accès aux ressources éducationnels développés dans le cadre du Unitwin UNESCO Campus Numérique des Systèmes Complexes

Mai 2016

• Le projet Renabi-IFB bioinformatique structurale est reconduit pour 18 mois à partir de septembre 2016

Mars 2016

• Une nouvelle service est maintenant disponible : PARSEC (PAtteRn Search and Contextualization) est une plate-forme open source pour la découverte et la caractérisation de sites courts dans les génomes complets eucaryotes

• Une nouvelle service est maintenant disponible : ImAnno fournit un accès public à diverses bases de données et outils pour l’annotation et l'analyse intégrés d’images d'hybridation in situ (ISH)

Février 2016

• 22 février, Première réunion du Comité de Pilotage Externe : bilan 2015 des activités au sein de l'IFB, bilan 2015 de la plate-forme (matériel, services,participation aux groupes de travail IFB/Elixir) et besoins / perspectives pour 2016 (axes thématiques prioritaires, demandes de financement)