CSTB team: Complex Systems and Translational Bioinformatics

People

From CSTB team: Complex Systems and Translational Bioinformatics
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Team leaders : Julie Thompson

Tenured staff :


Associated members :


Post-Doctorants :


Temporary teaching staff :

Engineers :


PhD students :


Trainees :

  • Jérémie Carabin, M2 BSIB (11/03/2024-26/04/2024), Supervisor: Kirsley Chennen et Olivier Poch
  • Mathilda Moser, M1 BSIB (11/03/2024-26/04/2024), Supervisor: Odile Lecompte
  • Marie Siroux, M1 BSIB (11/03/2024-26/04/2024), Supervisor: Kirsley Chennen
  • Céline Masson, M1 BSIB (11/03/2024-26/04/2024), Supervisor: Julie Thompson
  • Adem Bouhkari, M2 Intelligence en données de santé, Supervisor: Kirsley Chennen
  • Hugues Petitjean, ICAM Data Scientist, Supervisor: Kirsley Chennen
  • Zephyrin Enaux, M2 BSIB (01/2024-06/2024). Supervisors: Julie Thompson and Anne Jeannin

Administrative staff :



Former members of CSTB

Former tenured staff :

  • Ali Ayadi Associate professor
  • Catherine Guth Associate professor
  • Jean Muller (09/09-12/15)
  • Nicolas Wicker (10/99-09/12)

Former engineers :

  • Raymond Ripp Research engineer (09-91/01-18)
  • Hélène Polvèche (10/13-07/15)
  • Vincent Walter (05/11-08/14)
  • Paul Nicodème (02/09-10/11)
  • Guillaume Berthommier (06/04-03/09)
  • Annaïck Carles (11/01-11/07)

Former post-doctoral researchers :

Former PhD students :

Former temporary teaching staff :

Former temporary engineers :

  • Marc Haegelin (09/18-11/18)
  • Anna Leonteva (06/17-11/17)
  • Raphael Schneider (09/14-05/17)
  • Raaj Seereekissoon (09/15-06/16)

Former internships (sandwich courses) :

  • Ihsane Errami, L3 CNAM apprentissage (09/22-06/23). Supervisors: Olivier Poch and Arnaud Kress
  • Anastasia Villien, M2 SYNVA apprentissage, SFC-ESPE (10/19-10/20), co-encadrants : Pierre Collet & Anne Jeannin-Girardon.
  • Alexandre Bruyant, Master informatique (09/16-09/18), encadrante Anne Jeannin-Girardon
  • Marc Haegelin, Master informatique (09/16-09/18), co-encadrants Anne Jeannin-Girardon & Christian Rolando (Univ. Lille)
  • Isaac Abotsi, Master1 Informatique (09/15-09/17), encadrant Pierre Collet

Former internships :

  • Laura Billard, M1 Biologie Santé (01/2024-06/2024). Supervisor: Kirsley Chennen
  • Fazil Mammadov, M2 UFAZ, Baku (03/2023-06/2023). Supervisor: Rabih Amhaz
  • Rita Arfoul, M2 Lebanese University (1/23-9/23). Supervisor: Nathalie Makdessi, Kirsley Chennen et Olivier Poch
  • Lucille Herbay, M2 BSIB (01/23-06/23). Supervisors: Julie Thompson and Arnaud Kress
  • Burak Arti, M1 BSIB (3/23-5/23). Supervisors : Julie Thompson and Laetitia Poidevin
  • Julien Schaffer, M1 BSIB (3/23-5/23). Supervisors : Julie Thompson and Kirsley Chennen
  • Dehelia Chettouf, M1 BSIB (3/23-5/23). Supervisors : Claudine Mayer, Kirsley Chennen and vOlivier Poch
  • Migena Bejko, M1 BSIB (3/23-5/23). Supervisors : Kirsley Chennen, Claudine Mayer and Olivier Poch
  • Deborah Antonio, M1 BSIB (3/23-5/23). Supervisors : Claudine Mayer and Olivier Poch
  • Afaf Tissafi-Idrissi, M2 ESBS (14/11/22-16/12/22). Supervisors : Julie Thompson and Corentin Meyer
  • Komlan Amegah, L3 informatique Unistra. 01/06-22/07. Supervisors : Quentin Christoffel, Ali Ayadi and Anne Jeannin-Girardon
  • Samuel Lebot, L3 indormatique Unistra. 01/06-22/07. Supervisor : Anne Jeannin-Girardon
  • Pierre Michel, M1 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg, (6/22-7/22), supervisors Julie Thompson, Nicolas Scalzitti, Kirsley Chennen.
  • Inès Wurch, L2 Sciences de la Vie, biologie moléculaire et cellulaire (06/22), supervisor Julie Thompson, Nicolas Scalzitti, Corentin Meyer.
  • Jérémie Carabin, L2 Sciences de la Vie, biologie moléculaire et cellulaire (06/22), supervisor Julie Thompson, Olivier Poch.
  • Rayane Salaa, M2 Biologie-santé, Université de Strasbourg (03/22-08/22), supervisor Pierre Collet.
  • Henri Joel Azemena, M2 Traitement Automatique des Langues, Université de Lorraine (03/22-07/22), supervisor Ali Ayadi.
  • Khayala Gaybaliyeva, M2 Sciences de Données et Intelligence Artificielle, Université Franco-Azerbaidjanaise (02/22-06/22),supervisor Nathalie Al Makdessi.
  • Mahir Israyilov, M2 Sciences de Données et Intelligence Artificielle, Université Franco-Azerbaidjanaise (02/22-06/22), supervisor Ali Ayadi, Anne Jeannin-Girardon and Pierre Collet.
  • Nicolas Haas, M2 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (01/22-05/22), supervisor Olivier Poch
  • Arthur Vogt, M2 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (11/21-05/22), supervisor Claudine Mayer.
  • Dorine Merlat, M2 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (11/21-05/22), supervisor Odile Lecompte.
  • Tuba Uslu, stagiaire M1 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg, (3/22-4/22), encadrante Julie Thompson.
  • Anthony Seyller, stagiaire M1 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg, (3/22-4/22), encadrante Claudine Mayer
  • Timothé Benoit, stagiaire M1 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg, (3/22-4/22), encadrante Claudine Mayer
  • Souliman El Moussaoui, stage de l'ECAM formation data scientist (3/22-4/22), encadrants Julie Thompson, Kirsley Chennen, Nicolas Scalzitti.
  • Raaj Seereekissoon, stage de l'ECAM formation data scientist (3/22-4/22), encadrant Pierre Collet
  • Appoline Dubois, stagiaire ESBS (15/11-17/12/21), encadrante Odile Lecompte.
  • Nicolas Haas, stagiaire M2 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (09/11-03/12/21), encadrant Olivier Poch.
  • Arthur Vogt, stagiaire M2 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (09/11-03/12/21), encadrante Claudine Mayer.
  • Dorine Merlat, stagiaire M2 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (09/11-03/12/21), encadrante Odile Lecompte.
  • Lucille Herbay, stagiaire M2 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (09/11-03/12/21), encadrante Julie Thompson.
  • Dorine Merlat stagiaire M1 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (31/05 au 16/07/21), encadrante Odile Lecompte.
  • William Boehler, stagiaire M2 informatique, Sciences et ingénierie des réseaux, de l'internet et des systèmes, Université de Strasbourg (14/04 au 30/09/21), encadrant Pierre Parrend.
  • Raed Alwan, stagiaire M2 maths et applis parcours maths de l'info cryptographie, Université de Rennes (15-03 au 15/09/21), encadrant Rabih Amhaz.
  • Julien Michel, M2 informatique, sciences des données et systèmes complexes, Université de Strasbourg (22/02 au 30/07/21), encadrant Pierre Parrend.
  • Quentin Christoffel, M2 informatique, sciences des données et systèmes complexes, Université de Strasbourg (15/02 au 30/07/21), encadrante Anne Jeannin.
  • Christopher Gauger, BTS SIO (31/5 au 2/7), encadrant Pierre Parrend
  • Léonardo Nassabain (M1 SDSC) en stage (modélisation d'événements climatiques). Encadrement Pierre Collet
  • Clément Ligneul (L3 informatique) en stage (interface EASEA / GAIA). Encadrement Pierre Collet / Anne Jeannin-Girardon
  • Baptiste Rostalski (L3 informatique) en stage (étude de la conjecture de Syracuse). Encadrement Pierre Collet
  • Julien Duprat (L3 informatique) en stage (calcul quantique). Encadrement Pierre Collet
  • Léo Cheneau (L3 informatique) en stage (calcul quantique). Encadrement Pierre Collet
  • Saidanur Sideifzada (L3 informatique UFAZ) en stage (modélisation d'événements climatiques et de correspondance DXA-échographie pour l'évaluation de la masse musculaire). Encadrement Pierre Collet
  • Luc Negroni, stagiaire DU BII, Université Paris-Diderot (08/04 au 31/05/21) encadrante Julie Thompson.
  • Selim Turan, M2 SdV Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (04/01 au 28/05/21), encadrant Olivier Poch.
  • Dorine Merlat stagiaire M1 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (01/03 au 16/04/21), encadrante Odile Lecompte.
  • Lucille Herbay, Stagiaire M1 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (01/03 au 16/04/21) encadrante Julie Thompson.
  • Nicolas Haas, stagiaires M1 SdV, Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (01/03 au 16/04/21), encadrante Odile Lecompte.
  • Arnaud Buzon, M2 Biotechnologies et Ingénierie Moléculaire, Université Nancy (05/10/20 au 02/04/21), encadrante Claudine Mayer.
  • Selim Turan, M2 SdV Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (09/11 au 04/12/2020), encadrant Olivier Poch.
  • Lucien Hoffbeck, M2 SdV Biologie structurale intégrative et bio-informatique, Université de Strasbourg (09/11 au 04/12/2020), encadrante Julie Thompson.
  • Mireille Akouvi Degue, M2 systèmes intelligents et multimedias, IFI, Université Nationale Vietnam (20/04-20/10/20), encadrant Rabih Amhaz.
  • Loup Petit, M1 ESBS (01/07-28/08/20) encadrante Julie Thompson.
  • Vincent Sifferlen,M2 ingénieur généraliste ECAM (18/05-21/08/20), encadrant Pierre Parrend.
  • Hiba Khodji, M2, M2SI Rabat Maroc, Data Sciences and Artificial Intelligence (01/03-15/08/20), encadrante, Anne Jeannin.
  • Louis Bodot étudiant 3e année (E.N.S. Ulm) (12/06-07/08/20), encadré par Jean-Sébastien Sereni.
  • Baptiste Mouillon étudiant 3e année (E.N.S. Ulm) (12/06-07/08/20), encadré par Christian Michel & Jean-Sébastien Sereni.
  • Ursula Houessou, stagiaire M1 ESBS(29/06-31/07/20) encadrante Julie Thompson.
  • Lucien Hoffbeck, M1, SdV (15/06-31/07/20), encadrante Odile Lecompte.
  • Quentin Christoffel, M1 informatique, sciences des données et des systèmes complexes (03/06-31/07/20), encadrante Anne Jeannin.
  • Alexandre Roux, stagiare M2 ingénieur généraliste ECAM (18/05-17/07/20), encadrant, Pierre Parrend.
  • Corentin Meyer, M2 ESBS Biotechnologies: biotechnologie et analyse haut débit (13/01-17/07/20), encadrante Julie Thompson.
  • Christelle Rutz, M2 SdV biologie Structurale intégrative et bio-informatique (06/01-29/05/20), encadrante Odile Lecompte.
  • Célia Enderlin, M2 SdV biologie Structurale intégrative et bio-informatique (06/01-29/05/20), encadrante Claudine Mayer.
  • Clémence Langbour, M1, SdV biologie Structurale intégrative et bio-informatique (02/03-17/04/20), encadrante, Claudine Mayer.
  • Augusta Rayard, M1, SdV biologie Structurale intégrative et bio-informatique (02/03-17/04/20), encadrante, Julie Thompson.
  • Lucien Hoffbeck, M1, SdV biologie Structurale intégrative et bio-informatique (02/03-17/04/20), encadrante, Odile Lecompte.
  • Clément Chevalier, M2 SdV biologie Structurale intégrative et bio-informatique (12/11-06/12/19), encadrante Claudine Mayer.
  • Manh Dung Do, M2 SdV biologie Structurale intégrative et bio-informatique (12/11-06/12/19), encadrante Julie Thompson.
  • Hosna Baniadam, stagiaire double cursus Médecine Sciences (05/08-27/09/19) encadrante Odile Lecompte.
  • Rémi Trimbour, stagiaire double cursus Médecine Sciences (17/06-16/08/19), encadrante Julie Thompson.
  • Celia Enderlin, stagiaire M1 SdV : Biologie structurale intégrative et bioinformatique (08/07-03/08/19), encadrante Odile Lecompte.
  • Amadou Oury Bah, stagiaire M1 informatique : Sciences des Données et Systèmes Complexes (03/06-31/07/19), encadrante Anne Jeannin-Girardon.
  • Amarin Hutt, stagiaire M1 informatique : Sciences des Données et Systèmes Complexes (03/06-31/07/19), encadrante Anne Jeannin-Girardon.
  • Corentin Mengel, stagiaire Magistère de Mathématiques (10/06-26/07/19), encadrante Anne Jeannin-Girardon.
  • Quentin Christoffel, stagiaire L3 informatique (13/05-12/07/2019), encadrant Pierre Collet.
  • François Gaillot, stagiaire L3 SdV, biologie moléculaire et cellulaire (20/05-28/06/2019), encadrante Julie Thompson.
  • Arnaud Buzon, Stagiaire M1 ORI BBM&RC, Université de Lorraine (08/04-31/05/2019), encadrante Claudine Mayer.
  • Célia Enderlin, M1 Biologie structurale intégrative et bio-informatique (18/03-08/04/19), encadrant Yannis Nevers
  • Franck Martin, M1 Biologie structurale intégrative et bio-informatique (18/03-05/04/19), encadrante Julie Thompson
  • Christelle Rutz, M1 Biologie structurale intégrative et bio-informatique (18/03-05/04/19), encadrante Odile Lecompte
  • Mathias Galati, M2 Biologie structurale intégrative et bio-informatique (12/11-07/12/18), encadrante Claudine Mayer
  • Jean-Baptiste Lamouche, M2 Biologie structurale intégrative et bio-informatique (12/11-07/12/18), encadrant Olivier Poch.
  • Eloi Schmauch, M1 double-cursus Médecine-Sciences (27/08-21/09/18), encadrante Julie Thompson.
  • Martin Heitz, L3-Ingénierie MathInfo (11/06-03/08/18) encadrante Catherine Guth
  • Camille Depenveiller, 3e année Ingénieur ESBS (01/02-31/07/18) encadrant Olivier Poch
  • Oussama Ziat, Master-2 Faculté des Sciences et Techniques de Tanger, Maroc(19/03-27/07/18) encadrant Pierre Parrend
  • Priscilla Deschamps, Master-1, Microbiologie Univ Claude Bernard Lyon (04/06-25/07/18) encadrante Claudine Mayer
  • Olivier Dennler, Master-1, bioinformatique SdVE Univ Rennes (16/04-13/06/18) encadrante Julie Thompson
  • Nicolas Scalzitti, Master-2 SdV (08/01-02/06/18) co-encadrants Laetitia Poidevin et Olivier Poch
  • Thomas Weber, Master-2 SdV (08/01-01/06/18) encadrante Julie Thompson
  • Mathias Galati, Master-1 SdV (19/03-06/04/18) encadrante Julie Thompson
  • Victor Grentzinger, Master-1 SdV (19/03-06/04/18) encadrante Odile Lecompte
  • Max Hengel, Master-1 SdV (19/03-06/04/18) encadrante Julie Thompson
  • Mateusz Rauch, Master-1 SdV (19/03-06/04/18) encadrants Odile Lecompte, Yannis Nevers
  • David Stocklausen, Master-1 SdV (19/03-06/04/18) encadrant Olivier Poch
  • Laura Dutto, Ingénieur ESBS (13/11-15/12/17) encadrante Odile Lecompte
  • Quentin Rott, Master-2 SdV (06/11-01/12/17) encadrante Julie Thompson
  • Clémentine Leporcq, Master-2 SdV (06/11-01/12/17) encadrante Julie Thompson
  • Thomas Weber, Master-2 SdV (06/11-01/12/17) encadrante Julie Thompson
  • Maxime Grosjean, EPITECH 2e année expert technologie de l'info (03/07-03/11/17) encadrant Luc Moulinier
  • Nestor Demeure, ingénieur ENSIIE (13/02-11/08/17) encadrante Anne Jeannin Girardon
  • Nicolas Scalzitti, Master-1 SdV (12/06-04/08/2017) encadrant Raymond RIPP
  • Dylan Durand, DUT Génie Biologique, Clermont-Ferrand (03/04-28/07/17) encadrante Julie Thompson
  • Birger Lenz, Ingénieur ESBS (22/05-21/07/17) encadrant Raymond RIPP
  • Arthur Caillol, stage découverte Lycée 2nd (26/06-30/06/17) encadrant Pierre Collet
  • Corentin Steiner stage découverte Lycée 2nd (12/06-23/06/17) encadrant Arnaud Kress
  • Paul-Armand Michaud, Licence informatique (20/03-09/06/17) encadrant Pierre Collet
  • Audrey Defosset, Master-2 SdV (03/-02/06/17) encadrante Odile Lecompte
  • Viviane Nguefack Ngoune, Master-2 SdV (02/01-31/05/17) encadrante Julie Thompson
  • Anna Ouskova Leonteva, Master-2 MathInfo (21/09/16-25/05/17)encadrante Julie Thompson
  • Sarah Djeddi, Master-1 SdV (13/03-31/03/17) encadrante Odile Lecompte
  • Nicolas Scalzitti, Master-1 SdV (13/03-31/03/17) encadrante Julie Thompson
  • Asmaoul Sa Thaoubane, Master-1 SdV (13/03-31/03/17) encadrante Julie Thompson
  • Rémi Schilling, stage découverte Lycée 2nd (13/03-18/03/17) encadrante Anne Jeannin Girardon
  • Vincent Zilliox, Master-2 SdV, (02/11-25/11/16), encadrante Julie Thompson
  • Audrey Defosset, Master-2 SdV (02/11-25/11/16) encadrante Odile Lecompte
  • Cédric Pupka ingénieur CESI/EXIA (22/02-19/08/16) encadrant Pierre Parrend
  • Fantin Mesny, ingénieur ESBS (17/05-12/08/16) encadrante Odile Lecompte
  • Anna Ouskova Leonteva, DU/C1 IIEF (15/03/16-29/07/16) encadrante Julie Thompson
  • Mickaël Wagner, BTS CESI/SAS (15/06-07/07/16) encadrant Raymond Ripp
  • Nicolas Toussaint, Master-2 MathInfo (15/09/15-30/06/16) encadrant Pierre Parrend
  • Vanessa Fernandes Cardoso, Master-2 SdV (01/11-11/06/16) encadrant Olivier Poch
  • Morgan Gilg, Master-2 SdV (04/01-04/06/16) encadrante Julie Thompson
  • Hélène Gass, Master-2 SdV (04/01-03/06/16) encadrante Julie Thompson
  • Anna Ouskova Leonteva, Master-2 MathInfo (21/09/16-31/05/17) encadrante Julie Thompson
  • Omar Abou Saada, Master-1 SdV (29/02-17/03/16), encadrante Julie Thompson



Former members of SONIC

Invited professors :

  • Jaroslav Arabas (04/11-05/11)
  • Wolfgang Banzhaf (04/10-09/10)
  • Hiroshi Mamitsuka (05/09)

Research visitors :

  • Tahar Mehenni, Université de M'sila, Algérie (10/10 & 12/11)

Former tenured staff :

Former post-doctoral researchers :

  • Carlos Catania (02/14-01/15)
  • Lidia Yamamoto (05/10-05/11)
  • Deepak Sharma (05/09-05/10)

Former PhD students :

  • Stéphane Querry (9/10-9/14)
  • Igor Santos Peretta (2/11-2/15)
  • Aymen Sellaouti
  • Frédéric Krüger (10/10-2/14)
  • Wei Yan (9/10-2/14)
  • Ogier Maitre (10/08-12/11)
  • Emmanuel Benard (10/07-12/11)
  • Ahmed Ahmed (11/05-10/10)
  • Olivier Kuhn (10/07-10/10)